More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0068 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  79.05 
 
 		 454 aa  687    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  78.6 
 
 		 454 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  78.38 
 
 		 454 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  81.26 
 
 		 456 aa  703    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  100 
 
 		 453 aa  902    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  71.2 
 
 		 463 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  81.76 
 
 		 455 aa  712    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  82.88 
 
 		 455 aa  718    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  71.88 
 
 		 467 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  72.17 
 
 		 477 aa  630  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  71.82 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  71.53 
 
 		 461 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  70.98 
 
 		 467 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  71.82 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  71.82 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  71.82 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  71.82 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  71.82 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  71.88 
 
 		 467 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  71.59 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  70.62 
 
 		 470 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  71.07 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  70.39 
 
 		 470 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  70.39 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  70.39 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  70.62 
 
 		 470 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  71.59 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  69.78 
 
 		 474 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  69.14 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  68.15 
 
 		 470 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  70.85 
 
 		 467 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  70.56 
 
 		 458 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  71.33 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  68.82 
 
 		 456 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  70.09 
 
 		 458 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  70.65 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  68.14 
 
 		 469 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  69.07 
 
 		 473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  69.09 
 
 		 463 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  53.96 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  49.55 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  51.08 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  42.52 
 
 		 495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  42.86 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  37.22 
 
 		 482 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  38.12 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  36.78 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  38.37 
 
 		 485 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  35.96 
 
 		 483 aa  244  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  36.97 
 
 		 467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  36.97 
 
 		 467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  36.97 
 
 		 467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  37.62 
 
 		 499 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  38.12 
 
 		 482 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  37.89 
 
 		 482 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  37.89 
 
 		 482 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  37.16 
 
 		 479 aa  236  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  36.63 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  36.4 
 
 		 480 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  36.73 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  38.24 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  37.56 
 
 		 479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  35.94 
 
 		 505 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  37.71 
 
 		 486 aa  223  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  39.13 
 
 		 488 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  36.27 
 
 		 486 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  37.5 
 
 		 471 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  35.15 
 
 		 500 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  34.95 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  38.78 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  33.57 
 
 		 509 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  33.57 
 
 		 509 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  33.57 
 
 		 509 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  35.44 
 
 		 468 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  35.82 
 
 		 497 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  28.15 
 
 		 456 aa  146  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  27.62 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  28.84 
 
 		 483 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  27.03 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  27.03 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  27.03 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  26.84 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  26.84 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  26.84 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  26.84 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  26.79 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  25.88 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 468 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 468 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 		 468 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  25.65 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  24.47 
 
 		 468 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.21 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>