More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0475 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  77.71 
 
 
467 aa  703    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  100 
 
 
468 aa  908    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  76.84 
 
 
463 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  63.01 
 
 
486 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  58.28 
 
 
480 aa  527  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  57.11 
 
 
482 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  56.9 
 
 
482 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  57.79 
 
 
467 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  57.79 
 
 
467 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  56.03 
 
 
482 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  57.79 
 
 
467 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  59.09 
 
 
479 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  56.47 
 
 
482 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  56.25 
 
 
482 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  56.25 
 
 
482 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  60.09 
 
 
469 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  56.72 
 
 
483 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  58.5 
 
 
479 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  55.82 
 
 
486 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  57.84 
 
 
479 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  59.73 
 
 
490 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  56.1 
 
 
488 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  55.56 
 
 
471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  47.02 
 
 
467 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  41.51 
 
 
499 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 
509 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 
509 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  44.35 
 
 
509 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  43.7 
 
 
485 aa  317  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  40.57 
 
 
505 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  40.49 
 
 
500 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  38.88 
 
 
497 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  38.42 
 
 
441 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  34.83 
 
 
467 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  34.83 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  35.05 
 
 
467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  36.39 
 
 
445 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  34.64 
 
 
463 aa  216  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  33.98 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  36.61 
 
 
469 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  36.61 
 
 
469 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  36.61 
 
 
469 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  36.36 
 
 
469 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  36.61 
 
 
469 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  34.33 
 
 
470 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  34.82 
 
 
477 aa  210  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  36.48 
 
 
445 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  36.76 
 
 
469 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  36.36 
 
 
469 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  36.36 
 
 
469 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  36.62 
 
 
470 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  36.62 
 
 
470 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  36.62 
 
 
470 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  34.23 
 
 
474 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  35.87 
 
 
470 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  35.68 
 
 
454 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  33.64 
 
 
470 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  35.89 
 
 
455 aa  206  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  35.28 
 
 
455 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  35.1 
 
 
463 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  34.43 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  34.06 
 
 
470 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  35.56 
 
 
454 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  33.71 
 
 
456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  35.84 
 
 
458 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  34.87 
 
 
454 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  35.09 
 
 
470 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  35.51 
 
 
473 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  35.35 
 
 
456 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  34.61 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  33.19 
 
 
469 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  34.63 
 
 
457 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  32.77 
 
 
495 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  33.72 
 
 
467 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  34.09 
 
 
453 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  34.14 
 
 
443 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  33.59 
 
 
467 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  27.55 
 
 
456 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  28.34 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.67 
 
 
467 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.67 
 
 
467 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.46 
 
 
467 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.18 
 
 
476 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.21 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.21 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  27.38 
 
 
471 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.54 
 
 
467 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  29.71 
 
 
463 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  29.71 
 
 
463 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.97 
 
 
467 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 
476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  27.14 
 
 
471 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.84 
 
 
467 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.84 
 
 
467 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 
483 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>