More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0838 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  74.73 
 
 
467 aa  686    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  100 
 
 
456 aa  924    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  44.27 
 
 
483 aa  328  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  42.83 
 
 
474 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  41.83 
 
 
465 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  40.8 
 
 
483 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  29.56 
 
 
441 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  30.36 
 
 
461 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  29.55 
 
 
470 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  30.9 
 
 
469 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  30.9 
 
 
469 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  30.9 
 
 
469 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  30.9 
 
 
469 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  30.9 
 
 
469 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  30.9 
 
 
469 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  30.94 
 
 
470 aa  176  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  29.91 
 
 
470 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  30.56 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  30.34 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  30.81 
 
 
469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  30.45 
 
 
467 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  29.89 
 
 
470 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  29.89 
 
 
470 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  29.21 
 
 
467 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  30.42 
 
 
469 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  31.45 
 
 
463 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  29.69 
 
 
467 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  29.22 
 
 
467 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  32.15 
 
 
456 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  31.63 
 
 
458 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  30 
 
 
470 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  28.6 
 
 
445 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  31.16 
 
 
458 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  30.5 
 
 
457 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  31.43 
 
 
467 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  30.65 
 
 
455 aa  156  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  29.98 
 
 
477 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 
474 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 
463 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  28.29 
 
 
469 aa  143  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  31.66 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  25.77 
 
 
495 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  28.38 
 
 
470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  27.44 
 
 
463 aa  132  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  27.87 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 
456 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  29.87 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  29.73 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  29.66 
 
 
454 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  29.68 
 
 
454 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  28.97 
 
 
479 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  29.6 
 
 
482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  29.59 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  29.59 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  29.59 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  31.1 
 
 
486 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  30.36 
 
 
482 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  30.36 
 
 
482 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 
454 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  28.34 
 
 
483 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  27.38 
 
 
500 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  30.65 
 
 
482 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  28.66 
 
 
455 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  27.48 
 
 
467 aa  120  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  28.15 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  28.72 
 
 
488 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  28.11 
 
 
455 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  28.64 
 
 
468 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  30.16 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  28.97 
 
 
479 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  29.47 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  30.65 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  28.9 
 
 
471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  28.18 
 
 
486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  25.82 
 
 
499 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 
509 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 
509 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  25.66 
 
 
509 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  23.44 
 
 
458 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  28.25 
 
 
753 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  29.23 
 
 
469 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 
488 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  27.06 
 
 
505 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0974  amino acid permease-associated region  27.3 
 
 
502 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  21.35 
 
 
468 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  21.13 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  26.55 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  20.92 
 
 
468 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  22.59 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  22.05 
 
 
459 aa  90.9  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  24.52 
 
 
464 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 
497 aa  90.5  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  23.67 
 
 
467 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.47 
 
 
467 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  22.27 
 
 
470 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  23.62 
 
 
471 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.41 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.41 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 
468 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  23.71 
 
 
467 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>