More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4034 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  72.51 
 
 		 467 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  80.79 
 
 		 455 aa  719    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  90.29 
 
 		 454 aa  795    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  78.38 
 
 		 453 aa  654    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  73.11 
 
 		 461 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  73.27 
 
 		 469 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  91.39 
 
 		 454 aa  799    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  73.05 
 
 		 469 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  73.27 
 
 		 469 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  73.27 
 
 		 469 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 454 aa  894    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  85.21 
 
 		 456 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  73.05 
 
 		 470 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  74.21 
 
 		 463 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  71.59 
 
 		 474 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  73.27 
 
 		 469 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  73.9 
 
 		 469 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  73.27 
 
 		 469 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  71.27 
 
 		 470 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  71.4 
 
 		 467 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  72.83 
 
 		 470 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  72.61 
 
 		 470 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  72.61 
 
 		 470 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  73.27 
 
 		 469 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  71.49 
 
 		 470 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  80.35 
 
 		 455 aa  714    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  71.84 
 
 		 467 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  72.79 
 
 		 470 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  69.62 
 
 		 477 aa  628  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  70.09 
 
 		 457 aa  627  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  73.76 
 
 		 467 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  70.18 
 
 		 470 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  71.96 
 
 		 456 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  69.03 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  71.1 
 
 		 458 aa  618  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  71.65 
 
 		 463 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  72.31 
 
 		 455 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  70.6 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  71.11 
 
 		 473 aa  614  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  53.5 
 
 		 445 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  51.22 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  50.8 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  41.67 
 
 		 495 aa  312  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  42.5 
 
 		 467 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  36.96 
 
 		 483 aa  246  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  37.39 
 
 		 482 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  38.89 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  37.12 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  38.41 
 
 		 482 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  37.12 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  37.12 
 
 		 467 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  37.17 
 
 		 482 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  38.94 
 
 		 482 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  37.72 
 
 		 479 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  34.71 
 
 		 499 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  38.22 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  38.22 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  38.04 
 
 		 480 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  34.48 
 
 		 500 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  36.62 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  36.89 
 
 		 486 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  37.53 
 
 		 479 aa  226  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  37.09 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  38.87 
 
 		 488 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  38.23 
 
 		 469 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  35.79 
 
 		 467 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  36.77 
 
 		 479 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  34.83 
 
 		 463 aa  216  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  38.19 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  36.84 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  34.35 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  33.99 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  38.17 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  29.66 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  27.96 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  27.85 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  26.17 
 
 		 474 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.68 
 
 		 422 aa  123  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  26.79 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  30.59 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  32.73 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  27.49 
 
 		 460 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.76 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 462 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 462 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.22 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  26.81 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  28.61 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  28.61 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.74 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  28.61 
 
 		 467 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  27.15 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  28.87 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>