More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4336 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  100 
 
 
499 aa  995    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  64.21 
 
 
485 aa  543  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  51.71 
 
 
505 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  43.64 
 
 
482 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  44.17 
 
 
482 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  43.97 
 
 
482 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  43.03 
 
 
482 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  43.03 
 
 
482 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  43.32 
 
 
482 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  43.36 
 
 
509 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  43.36 
 
 
509 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  43.36 
 
 
509 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  46.46 
 
 
480 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  44.53 
 
 
486 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  46.68 
 
 
467 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  46.68 
 
 
467 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  46.68 
 
 
467 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  46.79 
 
 
500 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  43.58 
 
 
483 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  43.93 
 
 
479 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  41.75 
 
 
467 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 
497 aa  338  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  40.5 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  41.6 
 
 
486 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  46.36 
 
 
469 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  44.07 
 
 
467 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  45.51 
 
 
479 aa  323  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  45.28 
 
 
479 aa  323  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  41.3 
 
 
468 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  41.52 
 
 
488 aa  316  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  45.29 
 
 
490 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  41.82 
 
 
471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  34.27 
 
 
467 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  33.84 
 
 
467 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  35.4 
 
 
467 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  36.19 
 
 
455 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  35.55 
 
 
455 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  32.41 
 
 
461 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  34.19 
 
 
456 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  34.84 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  34.84 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  34.84 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  32.24 
 
 
470 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  34.84 
 
 
469 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  34.84 
 
 
469 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  34.84 
 
 
469 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  34.84 
 
 
469 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  34.84 
 
 
469 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  34.84 
 
 
469 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  34.77 
 
 
454 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  34.84 
 
 
469 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  34.84 
 
 
469 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  36.09 
 
 
455 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  34.13 
 
 
454 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  35.48 
 
 
463 aa  216  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  34.71 
 
 
454 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  34.33 
 
 
474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  33.83 
 
 
470 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  33.83 
 
 
470 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  37.62 
 
 
453 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  35.48 
 
 
470 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  34.14 
 
 
473 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  34.29 
 
 
458 aa  206  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  35.41 
 
 
470 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  34.6 
 
 
469 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  33.57 
 
 
457 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  34.05 
 
 
458 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  33.73 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  35.65 
 
 
445 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  32.67 
 
 
477 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  33.05 
 
 
441 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  33.17 
 
 
467 aa  191  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  31.28 
 
 
445 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  32.06 
 
 
495 aa  168  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  27.08 
 
 
475 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  26.55 
 
 
468 aa  120  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  26.25 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  27.43 
 
 
476 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  27.43 
 
 
476 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  27.43 
 
 
476 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  25.99 
 
 
485 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  28.07 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  25.99 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  26.25 
 
 
461 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  27.7 
 
 
477 aa  113  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 
466 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  26.77 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  26.03 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  26.03 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  26.03 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  27.25 
 
 
471 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  26.09 
 
 
461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  27.1 
 
 
472 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  25.82 
 
 
456 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.35 
 
 
489 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 
462 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  24.89 
 
 
459 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 
483 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>