More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2166 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 462 aa  916    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  75.66 
 
 		 477 aa  663    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  69.98 
 
 		 471 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  69.85 
 
 		 472 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  68.28 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  66.96 
 
 		 475 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  65.33 
 
 		 468 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  66.24 
 
 		 476 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  65.11 
 
 		 468 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  66.24 
 
 		 476 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  66.24 
 
 		 476 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  66.03 
 
 		 476 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  65.34 
 
 		 458 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  64.82 
 
 		 459 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  64.1 
 
 		 468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  64.9 
 
 		 459 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  64.9 
 
 		 458 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  65.12 
 
 		 458 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  64.54 
 
 		 468 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  64.54 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  63.88 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  64.32 
 
 		 468 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  63.66 
 
 		 459 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  59.87 
 
 		 466 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  48.36 
 
 		 488 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  48.62 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  39.52 
 
 		 462 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  40.58 
 
 		 472 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  40.58 
 
 		 472 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  38.28 
 
 		 473 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  40.58 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  38.28 
 
 		 473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  38.49 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  38.28 
 
 		 473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  40.91 
 
 		 472 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  39.01 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  38.28 
 
 		 473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  38.01 
 
 		 473 aa  319  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  38.9 
 
 		 473 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  39.19 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  38.48 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  38.06 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  38.48 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  38.48 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  38.48 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  38.48 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  38.57 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  38.48 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  38.79 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  39.05 
 
 		 471 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  38.57 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  41.37 
 
 		 468 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  41.27 
 
 		 468 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  41.27 
 
 		 468 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  38.18 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  37.69 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  41.27 
 
 		 468 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  37.97 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  38.24 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  39.46 
 
 		 463 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  41.04 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  41.04 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  41.04 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  41.04 
 
 		 468 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  38.39 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  39.2 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  38.39 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  38.39 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  38.04 
 
 		 466 aa  312  9e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  38.62 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  38.7 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  38.7 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  39.78 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  38.7 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  38.7 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  35.36 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  38.62 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  36.68 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  40.67 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  37.45 
 
 		 477 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  36.46 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  38.95 
 
 		 458 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0369  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 		 504 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  37.25 
 
 		 465 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  37.44 
 
 		 452 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  39.16 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  38.06 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  36.93 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  34.91 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  38.38 
 
 		 467 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 475 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  35.08 
 
 		 473 aa  299  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  36.03 
 
 		 469 aa  299  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 		 473 aa  299  9e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  38.26 
 
 		 467 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  37.8 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0577  amino acid permease  70.97 
 
 		 224 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>