More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0683 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 455 aa  873    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  55.83 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  53.23 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  47.65 
 
 		 472 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  47.64 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  47.75 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  47.86 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  47.66 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  48.55 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  47.77 
 
 		 475 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  47.52 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  47.59 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  47.59 
 
 		 476 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  47.59 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  47.25 
 
 		 476 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  47.3 
 
 		 458 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  47.14 
 
 		 459 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  47.07 
 
 		 458 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  45.33 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  47.1 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  47.18 
 
 		 468 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  46.73 
 
 		 468 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  49.27 
 
 		 468 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  49.27 
 
 		 459 aa  349  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  48.79 
 
 		 459 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  49.03 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 462 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  37.95 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  40.61 
 
 		 487 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  38.99 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  36.6 
 
 		 463 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  36.82 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31730  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  42.38 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  41.29 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  38.39 
 
 		 468 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  41.29 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  36.59 
 
 		 452 aa  292  7e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  36.17 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  36.38 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  41.05 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.3 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.3 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.3 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.3 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.3 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.53 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  35.95 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  38.36 
 
 		 468 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  38.36 
 
 		 468 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  38.36 
 
 		 468 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  38.32 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  38.13 
 
 		 468 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  38.13 
 
 		 468 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  38.13 
 
 		 468 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  38.13 
 
 		 468 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  36.09 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 		 462 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3570  GABA permease  41.9 
 
 		 464 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3468  gamma-aminobutyrate permease  41.9 
 
 		 464 aa  285  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3482  gamma-aminobutyrate permease  41.9 
 
 		 464 aa  285  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3853  GABA permease  41.9 
 
 		 464 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.261193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  38.03 
 
 		 471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  37.09 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  40.67 
 
 		 467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  37.81 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  39.23 
 
 		 458 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  37.28 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  42.44 
 
 		 467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  39.48 
 
 		 472 aa  283  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  39.23 
 
 		 458 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  36.84 
 
 		 460 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  36.84 
 
 		 460 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  36.84 
 
 		 460 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  37.14 
 
 		 461 aa  282  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01910  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  38.32 
 
 		 488 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  40.22 
 
 		 468 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  39.82 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1479  GABA permease  41.23 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10983  hitchhiker  0.00182133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  41.91 
 
 		 467 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  36.83 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  36.83 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  36.83 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  36.83 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  40.22 
 
 		 467 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  36.83 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  36.83 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  40.22 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  38.86 
 
 		 459 aa  280  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  36.67 
 
 		 456 aa  279  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  37.58 
 
 		 461 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  37.58 
 
 		 461 aa  279  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  37.36 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  37.36 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  37.36 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  37.36 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  37.88 
 
 		 473 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  36.61 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  40.24 
 
 		 449 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  36.97 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>