More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0961 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  84.28 
 
 		 459 aa  718    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  72.81 
 
 		 466 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  99.34 
 
 		 458 aa  886    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  73.9 
 
 		 471 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  84.5 
 
 		 468 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  85.37 
 
 		 468 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  96.94 
 
 		 459 aa  847    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  71.59 
 
 		 475 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  85.37 
 
 		 468 aa  736    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  85.15 
 
 		 459 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  99.78 
 
 		 458 aa  888    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  84.5 
 
 		 459 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  85.15 
 
 		 468 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  100 
 
 		 458 aa  891    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  67.17 
 
 		 472 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  64.67 
 
 		 468 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  65.23 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  64.67 
 
 		 468 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  65.01 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  65.23 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  65.23 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  64.9 
 
 		 462 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  66.67 
 
 		 477 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  55.95 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0577  amino acid permease  100 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 		 488 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  47.7 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  39.16 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  38.94 
 
 		 460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  39.16 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  39.16 
 
 		 460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  38.78 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  38.06 
 
 		 458 aa  322  8e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  38.06 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  38.86 
 
 		 462 aa  321  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  38.06 
 
 		 458 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  38.06 
 
 		 458 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  38.06 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  38.06 
 
 		 458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  38.06 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  38.36 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  39.86 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  39.86 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  39.86 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  39.86 
 
 		 461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  39.86 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  39.86 
 
 		 461 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  37.92 
 
 		 464 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  37.92 
 
 		 464 aa  319  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  37.92 
 
 		 464 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  37.92 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  37.84 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  37.92 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  35.75 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  38.77 
 
 		 471 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  38.33 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  37.84 
 
 		 458 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  38.14 
 
 		 485 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  36.49 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  38.43 
 
 		 461 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  38.36 
 
 		 471 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.2 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  38.2 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  38.2 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  39.55 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  38.2 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  36.26 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.26 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.26 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.26 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.26 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.26 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  36.04 
 
 		 463 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  36.04 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  36.06 
 
 		 462 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  36.64 
 
 		 472 aa  309  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  38.5 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  37.77 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  39.72 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  39.72 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  39.72 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  39.49 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  39.49 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  39.49 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  37.92 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  39.49 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  37.55 
 
 		 473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  37.34 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  37.01 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  37.34 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  38.04 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0583  amino acid permease-associated region  38.88 
 
 		 495 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0404374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  37.47 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 		 475 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  36.78 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>