More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2565 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  71.93 
 
 		 466 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  85.15 
 
 		 458 aa  747    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  85.37 
 
 		 458 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  84.93 
 
 		 458 aa  766    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  72.21 
 
 		 471 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  96.73 
 
 		 468 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  96.73 
 
 		 468 aa  858    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  85.62 
 
 		 459 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  94.77 
 
 		 459 aa  837    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  70.26 
 
 		 475 aa  634    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  96.95 
 
 		 468 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 459 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  98.47 
 
 		 459 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  96.73 
 
 		 468 aa  838    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  66.52 
 
 		 472 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  64.87 
 
 		 476 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  64.66 
 
 		 476 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  64.66 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  64.66 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  62.06 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  63.88 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  62.89 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  63.72 
 
 		 477 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  55.82 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  48.67 
 
 		 488 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0577  amino acid permease  84.38 
 
 		 224 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349006  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  47.44 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  38.53 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 		 471 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  39.6 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  39.38 
 
 		 471 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  37.45 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  36.26 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  37.72 
 
 		 461 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  37.23 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  38.37 
 
 		 459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  39.28 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  36.42 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  37.36 
 
 		 461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  37.67 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  37.67 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  37.67 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.16 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  36.26 
 
 		 463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  38.8 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 		 472 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 		 472 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  38.69 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  38.69 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  38.69 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  38.69 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.04 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  36.04 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  38.69 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  38.69 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.04 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.04 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  35.18 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.04 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.04 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  36.04 
 
 		 463 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  36.04 
 
 		 463 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  36.81 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  36.81 
 
 		 470 aa  300  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  36.81 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  36.81 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  36.81 
 
 		 458 aa  299  7e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  36.81 
 
 		 458 aa  299  7e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  36.81 
 
 		 470 aa  299  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  36.14 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  39.19 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  36.14 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  36.14 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  36.14 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  36.14 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  36.59 
 
 		 470 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  39.39 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  39.39 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  39.39 
 
 		 468 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  36.59 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  39.16 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  39.16 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  39.16 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  35.57 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  36.82 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  39.16 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  34.36 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  34.36 
 
 		 472 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  36.32 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  36.3 
 
 		 458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 		 462 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  36.95 
 
 		 473 aa  289  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  36.3 
 
 		 473 aa  289  9e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  36.54 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  36.54 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  35.24 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>