More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2830 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  100 
 
 
488 aa  972    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  57.48 
 
 
455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  49.42 
 
 
468 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  49.19 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  51.52 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  48.75 
 
 
472 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  49.02 
 
 
459 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  50 
 
 
477 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  50 
 
 
458 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  48.64 
 
 
466 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  50 
 
 
458 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  50 
 
 
458 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  48.36 
 
 
462 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 
459 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  48.44 
 
 
468 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  47.81 
 
 
459 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  48.78 
 
 
468 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  48.11 
 
 
475 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  49.53 
 
 
459 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  49.88 
 
 
468 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  49.65 
 
 
468 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  47.34 
 
 
476 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  46.8 
 
 
476 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  47.34 
 
 
476 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  47.34 
 
 
476 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  44.11 
 
 
466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 
467 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  40.93 
 
 
466 aa  300  5e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  39.7 
 
 
524 aa  298  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  36.06 
 
 
462 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  36.5 
 
 
463 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  37.41 
 
 
464 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  36.06 
 
 
463 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  37.76 
 
 
472 aa  293  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  36.06 
 
 
463 aa  292  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  35.84 
 
 
463 aa  292  9e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  38.92 
 
 
467 aa  292  9e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  37.53 
 
 
473 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  38.25 
 
 
472 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.3 
 
 
463 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.3 
 
 
463 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  35.4 
 
 
463 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.3 
 
 
463 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
475 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  38.77 
 
 
468 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  38.77 
 
 
468 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.3 
 
 
463 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.75 
 
 
463 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  38.77 
 
 
468 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  36.64 
 
 
452 aa  291  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.3 
 
 
463 aa  291  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
476 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  38.04 
 
 
487 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
475 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  38.53 
 
 
468 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  38.53 
 
 
468 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
475 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  38.53 
 
 
468 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  38.53 
 
 
468 aa  290  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  39.95 
 
 
479 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  37.33 
 
 
475 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  39.95 
 
 
479 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  37.33 
 
 
475 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  40.05 
 
 
477 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  38.72 
 
 
468 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  37.18 
 
 
459 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  36.66 
 
 
473 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  37.33 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  37.83 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  37.06 
 
 
473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  38.05 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  38.6 
 
 
458 aa  287  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  36.7 
 
 
468 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  35.88 
 
 
471 aa  285  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0369  amino acid permease-associated region  39.95 
 
 
504 aa  285  9e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  36.56 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  37.21 
 
 
474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  36.16 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  39.2 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 
467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  36.72 
 
 
473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  36.88 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  37.61 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  39.72 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  39.16 
 
 
472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 
460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 
460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  39.72 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  36.38 
 
 
460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  36.56 
 
 
468 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  35.32 
 
 
475 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  37.69 
 
 
464 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  36.49 
 
 
473 aa  282  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  36.65 
 
 
472 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0583  amino acid permease-associated region  38.66 
 
 
495 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0404374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  36.49 
 
 
473 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  36.49 
 
 
473 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  36.49 
 
 
473 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  36.99 
 
 
469 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  38.08 
 
 
464 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>