More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0577 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  99.55 
 
 		 458 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  100 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  100 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0577  amino acid permease  100 
 
 		 224 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349006  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  97.32 
 
 		 459 aa  424  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  84.82 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  84.38 
 
 		 459 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  84.38 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  84.82 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  84.38 
 
 		 459 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  83.93 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  84.38 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  79.91 
 
 		 466 aa  360  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  80.63 
 
 		 471 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  79.73 
 
 		 475 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  71.81 
 
 		 472 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  67.57 
 
 		 468 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  67.12 
 
 		 468 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  70.97 
 
 		 462 aa  298  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  69.27 
 
 		 477 aa  292  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  68.86 
 
 		 476 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  68.86 
 
 		 476 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  68.86 
 
 		 476 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  67.98 
 
 		 476 aa  285  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  56.76 
 
 		 466 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  53.49 
 
 		 488 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  48.58 
 
 		 455 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31730  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  44.5 
 
 		 476 aa  174  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  42.11 
 
 		 462 aa  174  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  40.09 
 
 		 485 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  41.98 
 
 		 468 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  41.98 
 
 		 468 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  41.98 
 
 		 468 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  41.98 
 
 		 468 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  41.98 
 
 		 468 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  41.98 
 
 		 468 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  41.98 
 
 		 468 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  41.98 
 
 		 468 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  43.06 
 
 		 461 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  43.06 
 
 		 461 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  43.06 
 
 		 461 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  43.06 
 
 		 461 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  43.06 
 
 		 461 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  43.06 
 
 		 461 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0705  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 		 457 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  39.64 
 
 		 485 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4269  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 		 461 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  40.85 
 
 		 458 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1594  aromatic amino acid transport protein  43.06 
 
 		 461 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  40.85 
 
 		 470 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  40.85 
 
 		 470 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  40.85 
 
 		 470 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  40.28 
 
 		 461 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  40.85 
 
 		 458 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  40.85 
 
 		 458 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  40.85 
 
 		 458 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  40.28 
 
 		 461 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  40.85 
 
 		 458 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  40.85 
 
 		 458 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4232  amino acid permease-associated region  41.15 
 
 		 461 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 		 461 aa  167  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4502  amino acid permease-associated region  39.23 
 
 		 461 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  41.63 
 
 		 462 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  40.87 
 
 		 457 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  40.19 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  40.87 
 
 		 457 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  40.87 
 
 		 457 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3758  amino acid permease-associated region  40.67 
 
 		 461 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.230663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  38.01 
 
 		 471 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  39.81 
 
 		 447 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  40.38 
 
 		 464 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  40.38 
 
 		 464 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  40.38 
 
 		 464 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  39.81 
 
 		 447 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  39.81 
 
 		 447 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  40.38 
 
 		 464 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4018  amino acid permease-associated region  40.67 
 
 		 461 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  38.79 
 
 		 462 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  40.38 
 
 		 464 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4349  amino acid permease-associated region  40.67 
 
 		 461 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  37.38 
 
 		 463 aa  165  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6005  amino acid permease-associated region  40.67 
 
 		 461 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.44513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0632  amino acid permease-associated region  41.15 
 
 		 448 aa  164  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  37.85 
 
 		 463 aa  164  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  37.85 
 
 		 463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  39.25 
 
 		 460 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  37.85 
 
 		 463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  37.85 
 
 		 463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  37.85 
 
 		 463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  37.85 
 
 		 463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  37.85 
 
 		 464 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  37.85 
 
 		 463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  37.85 
 
 		 463 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  39.25 
 
 		 460 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  39.25 
 
 		 460 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  36.92 
 
 		 463 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1671  amino acid transporter  40.19 
 
 		 461 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0584756  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2029  amino acid permease-associated region  44.08 
 
 		 461 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  37.38 
 
 		 463 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  39.23 
 
 		 461 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>