More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3225 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 467 aa  933    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  54.59 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  55.26 
 
 		 452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  57.76 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  57.99 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  57.17 
 
 		 468 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  57.76 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  57.76 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  57.76 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  57.99 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  57.99 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  57.18 
 
 		 459 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  55.97 
 
 		 463 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  55.09 
 
 		 463 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  55.31 
 
 		 463 aa  494  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  54.32 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  55.31 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  55.31 
 
 		 463 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  55.31 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  55.31 
 
 		 463 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  55.31 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  55.31 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  54.65 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  54.87 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  51.54 
 
 		 475 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  53.76 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  52.09 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  51.08 
 
 		 461 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  52.94 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  50.65 
 
 		 461 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  53.76 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  53.76 
 
 		 460 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  51.08 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  54.22 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  52.6 
 
 		 447 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  52.63 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  52.6 
 
 		 447 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  52.6 
 
 		 447 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  53.28 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  53.28 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  51.92 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  54.22 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  52.58 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  54.07 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  50.43 
 
 		 485 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  49.67 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  51.83 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  46.62 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  47.06 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  48.89 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  47.31 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  47.31 
 
 		 461 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  47.31 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  47.31 
 
 		 461 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  47.31 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  47.31 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1513  gamma-aminobutyrate permease  48.3 
 
 		 491 aa  437  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  46.62 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  46.84 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3101  putative proline-specific permease  48.43 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  46.49 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  48.29 
 
 		 467 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  48.29 
 
 		 467 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3999  putative transport protein YifK  48.37 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00171121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0834  amino acid permease-associated region  46.84 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  48.29 
 
 		 472 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  45.55 
 
 		 460 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  46.85 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0905  amino acid permease-associated region  46.41 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  46.99 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  46.19 
 
 		 458 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  46.99 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  46.99 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  46.9 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  46.77 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  46.64 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4021  putative transport protein YifK  49.01 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0268328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0194  putative transport protein YifK  49.23 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3992  putative transport protein YifK  48.67 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00908983  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  47.99 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0524  putative transport protein YifK  49.01 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0732  amino acid permease-associated region  47.55 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1212  amino acid permease-associated region  47.55 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0671  amino acid permease-associated region  46.71 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  44.57 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3132  putative proline-specific permease  46.96 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  48.36 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  45.09 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1594  aromatic amino acid transport protein  47.76 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2854  amino acid permease  46.79 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0237037  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  44.87 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1185  amino acid permease-associated region  47.32 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199623  normal  0.379883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1046  putative proline-specific permease  47.82 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3570  amino acid permease-associated region  45.92 
 
 		 452 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3272  putative proline-specific permease  46.94 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0927  amino acid ABC transporter permease  45.92 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  46.49 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4320  amino acid transporter  46.62 
 
 		 455 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.619853  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0632  amino acid permease-associated region  45.29 
 
 		 448 aa  418  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3282  putative proline-specific permease  47.16 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0197243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>