More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4992 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 475 aa  939    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  52.9 
 
 		 463 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  52.9 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  52.46 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  52.46 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  52.46 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  52.46 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  52.46 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  52.68 
 
 		 463 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  52.46 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  52.23 
 
 		 463 aa  502  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  54.69 
 
 		 468 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  53.06 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  54.92 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  53.78 
 
 		 468 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  54.69 
 
 		 468 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  54.69 
 
 		 468 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  54.92 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  52.23 
 
 		 463 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  54.92 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  54.69 
 
 		 468 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  53.64 
 
 		 485 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  51.53 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  54.16 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  53.95 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  54.69 
 
 		 460 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  54.69 
 
 		 460 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  54.69 
 
 		 460 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  53.91 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  53.91 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  53.42 
 
 		 485 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  53.91 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  54.02 
 
 		 460 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  55.11 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  52.93 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  52.93 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  53.9 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  50.99 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  52.93 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  54.61 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  52.49 
 
 		 472 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  54.61 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  51.54 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  53.76 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  50.43 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  47.88 
 
 		 452 aa  455  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  49.89 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  49.01 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  49.67 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  49.67 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  49.89 
 
 		 459 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2891  L-asparagine permease  46.48 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  47.17 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  45.92 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3992  putative transport protein YifK  49.22 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00908983  normal  0.184456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  45.92 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  45.81 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  45.92 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.58 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3999  putative transport protein YifK  48.31 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00171121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  45.92 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.24 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.24 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.38 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  45.92 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  45.92 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  45.92 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  45.92 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.58 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.38 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.38 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.24 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  47.25 
 
 		 467 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  47.89 
 
 		 452 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  46.74 
 
 		 470 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  47.26 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3459  amino acid permease family protein  48.52 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00571455  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03674  predicted transporter  49.88 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000431202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3490  amino acid permease family protein  48.29 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.175253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4180  amino acid permease-associated region  49.88 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000115482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3471  amino acid permease  48.29 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0414864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0194  putative transport protein YifK  48.64 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3262  amino acid permease family protein  48.75 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000532253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  44.96 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03623  hypothetical protein  49.88 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000382279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4160  putative transport protein YifK  49.88 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000124284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4309  putative transport protein YifK  49.88 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000528729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3516  amino acid permease family protein  48.75 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1788  amino acid permease family protein  48.52 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4207  putative transport protein YifK  49.88 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000449535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  48.12 
 
 		 482 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4021  putative transport protein YifK  48.41 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0268328  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0524  putative transport protein YifK  48.41 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3477  amino acid permease family protein  48.52 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4014  putative transport protein YifK  49.88 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.1864e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5229  putative transport protein YifK  49.88 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000882979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  44.65 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  44.74 
 
 		 456 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3234  amino acid permease  48.29 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  6.42429e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3176  amino acid permease  48.06 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000126504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>