More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1046 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00350  predicted cryptic proline transporter  84.73 
 
 
457 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0500  putative proline-specific permease  84.67 
 
 
476 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.968025  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1046  putative proline-specific permease  100 
 
 
468 aa  929    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  84.89 
 
 
476 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3207  amino acid permease-associated region  84.73 
 
 
457 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.168679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3282  putative proline-specific permease  88.48 
 
 
463 aa  806    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0197243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0479  putative proline-specific permease  84.73 
 
 
457 aa  719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.339066  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1013  putative proline-specific permease  86.18 
 
 
458 aa  743    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2910  putative proline-specific permease  82.21 
 
 
459 aa  730    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00354  hypothetical protein  84.73 
 
 
457 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0321  putative proline-specific permease  84.73 
 
 
457 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.498957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3231  putative proline-specific permease  84.73 
 
 
457 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000934301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3272  putative proline-specific permease  88.7 
 
 
463 aa  808    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0432  putative proline-specific permease  84.73 
 
 
457 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  84.67 
 
 
476 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  84.67 
 
 
476 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0472  putative proline-specific permease  84.73 
 
 
457 aa  719    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3132  putative proline-specific permease  88.86 
 
 
464 aa  804    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3297  putative proline-specific permease  86.7 
 
 
458 aa  753    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3101  putative proline-specific permease  84.55 
 
 
450 aa  750    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  84.67 
 
 
476 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0870  putative proline-specific permease  82.96 
 
 
456 aa  733    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0433  putative proline-specific permease  84.73 
 
 
458 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  64.48 
 
 
467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  64.25 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  64.03 
 
 
467 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  61.93 
 
 
467 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  60.04 
 
 
472 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  59.96 
 
 
463 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  60.04 
 
 
467 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  60.04 
 
 
467 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  62.13 
 
 
458 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  61.9 
 
 
458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  61.82 
 
 
467 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3372  amino acid permease-associated region  59.15 
 
 
463 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.249173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0583  amino acid permease-associated region  59.78 
 
 
495 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0404374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  54.29 
 
 
459 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0905  amino acid permease-associated region  56.11 
 
 
460 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  54.89 
 
 
468 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0834  amino acid permease-associated region  56.11 
 
 
460 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  54.31 
 
 
464 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1516  amino acid permease  56.14 
 
 
454 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  57.14 
 
 
455 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2854  amino acid permease  56.14 
 
 
454 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0237037  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1385  amino acid transporter  56.14 
 
 
454 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351329  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1774  amino acid permease  56.14 
 
 
454 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0369  amino acid permease-associated region  59.21 
 
 
504 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1185  amino acid transporter  56.14 
 
 
454 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0685  amino acid transporter  56.14 
 
 
454 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0485493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1381  amino acid transporter  56.14 
 
 
454 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.568485  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0467  amino acid transporter  56.14 
 
 
454 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00613549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  56.7 
 
 
455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  56.12 
 
 
468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  56.35 
 
 
468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  57.14 
 
 
455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  56.12 
 
 
468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  56.12 
 
 
468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  56.35 
 
 
468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  56.35 
 
 
468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  56.12 
 
 
468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0458  amino acid permease-associated region  57.89 
 
 
457 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4320  amino acid transporter  56.7 
 
 
455 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.619853  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5046  histidine transport protein  55.77 
 
 
474 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0732  amino acid permease-associated region  56.92 
 
 
455 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  52.68 
 
 
462 aa  508  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1212  amino acid permease-associated region  56.92 
 
 
455 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  55.61 
 
 
472 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  54.42 
 
 
472 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  54.61 
 
 
472 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  54.61 
 
 
472 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1185  amino acid permease-associated region  56.7 
 
 
455 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199623  normal  0.379883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  50.98 
 
 
461 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  51.11 
 
 
485 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  52.04 
 
 
447 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5638  amino acid permease-associated region  56.76 
 
 
460 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24773  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  52.04 
 
 
461 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  55.13 
 
 
473 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  52.04 
 
 
447 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  50.66 
 
 
485 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  52.04 
 
 
447 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  53.91 
 
 
463 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  53.47 
 
 
463 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  53.47 
 
 
463 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  53.47 
 
 
463 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  53.47 
 
 
463 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  53.47 
 
 
463 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  53.47 
 
 
463 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  53.02 
 
 
463 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  53.02 
 
 
463 aa  488  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  54.21 
 
 
471 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  53.99 
 
 
471 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  52.8 
 
 
463 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  52.35 
 
 
463 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  53.06 
 
 
460 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  53.06 
 
 
460 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  53.06 
 
 
460 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  50.76 
 
 
471 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  52.63 
 
 
460 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  52.02 
 
 
459 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0065  amino acid transporter  49.11 
 
 
463 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>