More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0172 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 468 aa  926    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  60.62 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  58.01 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  58.01 
 
 		 463 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  58.01 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  57.79 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  57.58 
 
 		 463 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  58.01 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  58.01 
 
 		 463 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  57.36 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  57.79 
 
 		 463 aa  548  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  60.96 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  58.86 
 
 		 462 aa  548  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  60.96 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  60.96 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  57.14 
 
 		 463 aa  541  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  60.73 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  56.93 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  59.47 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  60.73 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  60.73 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  60.73 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  58.71 
 
 		 459 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  56.77 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  57.95 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  57.95 
 
 		 485 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  57.65 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  57.95 
 
 		 447 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  57.65 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  57.65 
 
 		 460 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  57.95 
 
 		 447 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  57.95 
 
 		 447 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  57.43 
 
 		 460 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  57.27 
 
 		 485 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  57.21 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  57.3 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  56.96 
 
 		 472 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  56.96 
 
 		 472 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  56.09 
 
 		 472 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  55.11 
 
 		 475 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  57.83 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  57.27 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  56.21 
 
 		 472 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  51.52 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  54.07 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  52.27 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  54.38 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3992  putative transport protein YifK  50.11 
 
 		 482 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00908983  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3999  putative transport protein YifK  49.13 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00171121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03674  predicted transporter  49.78 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000431202  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4180  amino acid permease-associated region  49.78 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000115482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03623  hypothetical protein  49.78 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000382279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4014  putative transport protein YifK  49.78 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.1864e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4207  putative transport protein YifK  49.78 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000449535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5229  putative transport protein YifK  49.78 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000882979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4160  putative transport protein YifK  49.78 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000124284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4309  putative transport protein YifK  49.78 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000528729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4125  putative transport protein YifK  49.57 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124535  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4210  putative transport protein YifK  50.22 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000256233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  49.45 
 
 		 467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4141  putative transport protein YifK  50.22 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000118516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4259  putative transport protein YifK  50.22 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000481193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4156  putative transport protein YifK  50.22 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000110979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4318  putative transport protein YifK  50.55 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0011437  normal  0.877333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  50.44 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0213  putative transport protein YifK  49.24 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268247  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4021  putative transport protein YifK  48.37 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0268328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  50.22 
 
 		 458 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0524  putative transport protein YifK  48.37 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0194  putative transport protein YifK  48.16 
 
 		 463 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145186  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4749  amino acid permease-associated region  52.65 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  48.55 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  48.89 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  48.7 
 
 		 467 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  48.57 
 
 		 467 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  48.57 
 
 		 467 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3272  putative proline-specific permease  50.33 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  48.35 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3132  putative proline-specific permease  50.33 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  50.22 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  50.22 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3282  putative proline-specific permease  50.33 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0197243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  50.22 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  50.22 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1788  amino acid permease family protein  48.46 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3471  amino acid permease  48.58 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0414864  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  51.04 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3176  amino acid permease  48.14 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000126504  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0065  amino acid transporter  46.96 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67310  putative amino acid permease  48.46 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  51.04 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3459  amino acid permease family protein  48.46 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00571455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3168  amino acid permease-associated region  48.02 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.206651  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0168  putative transport protein YifK  48.8 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00228239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  51.04 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3262  amino acid permease family protein  48.34 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000532253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3234  amino acid permease  48.12 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  6.42429e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0500  putative proline-specific permease  50.22 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.968025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3516  amino acid permease family protein  48.44 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3490  amino acid permease family protein  48.24 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.175253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>