More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1186 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  68.44 
 
 		 457 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4269  amino acid permease-associated region  85.68 
 
 		 461 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  68.22 
 
 		 456 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  68.75 
 
 		 457 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3494  amino acid permease-associated region  72.77 
 
 		 465 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  68.44 
 
 		 456 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  68.44 
 
 		 456 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0927  amino acid ABC transporter permease  71.81 
 
 		 453 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  73.48 
 
 		 460 aa  683    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  68.44 
 
 		 456 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  68.44 
 
 		 456 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4288  amino acid permease-associated region  71.59 
 
 		 451 aa  668    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1887  amino acid permease-associated region  70.31 
 
 		 466 aa  649    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  68.44 
 
 		 456 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3366  aromatic amino acid transport protein AroP  72.77 
 
 		 465 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0519215  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  99.57 
 
 		 461 aa  917    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0671  amino acid permease-associated region  74.5 
 
 		 453 aa  695    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4502  amino acid permease-associated region  81.26 
 
 		 461 aa  753    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3570  amino acid permease-associated region  74.11 
 
 		 452 aa  697    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  100 
 
 		 461 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1671  amino acid transporter  82.86 
 
 		 461 aa  757    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0584756  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  68.75 
 
 		 457 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1594  aromatic amino acid transport protein  95.88 
 
 		 461 aa  874    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  67.9 
 
 		 461 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  68.55 
 
 		 461 aa  646    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  83.33 
 
 		 462 aa  770    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0967  amino acid permease-associated region  71.59 
 
 		 453 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695825  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  68.75 
 
 		 457 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4018  amino acid permease-associated region  83.3 
 
 		 461 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131075  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  76.16 
 
 		 461 aa  720    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0933  amino acid permease-associated region  71.59 
 
 		 452 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3758  amino acid permease-associated region  83.08 
 
 		 461 aa  760    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.230663 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  99.57 
 
 		 461 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1037  aromatic amino acid transporter  72.99 
 
 		 465 aa  659    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.725191  normal  0.852119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6005  amino acid permease-associated region  83.3 
 
 		 461 aa  762    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.44513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  68.51 
 
 		 455 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4349  amino acid permease-associated region  83.3 
 
 		 461 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3756  amino acid permease-associated region  74.33 
 
 		 452 aa  696    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0213954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0632  amino acid permease-associated region  76.91 
 
 		 448 aa  716    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  68.44 
 
 		 457 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  99.57 
 
 		 461 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  68.22 
 
 		 456 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4232  amino acid permease-associated region  83.73 
 
 		 461 aa  764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  100 
 
 		 461 aa  920    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0705  amino acid permease-associated region  78.2 
 
 		 457 aa  725    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  99.57 
 
 		 461 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2179  amino acid permease-associated region  70.54 
 
 		 463 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0341805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  68.34 
 
 		 466 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  67.78 
 
 		 456 aa  633  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  66.67 
 
 		 456 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0168  aromatic amino acid transporter  66.44 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0171  aromatic amino acid transporter  66.44 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0164  aromatic amino acid transporter  66.44 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0163  aromatic amino acid transporter  66.44 
 
 		 456 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25270  aromatic amino acid transport protein AroP1  64.91 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4651  aromatic amino acid transport protein AroP2  64.25 
 
 		 472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  62.64 
 
 		 462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  63.09 
 
 		 458 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  63.09 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  63.09 
 
 		 458 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  63.09 
 
 		 458 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  62.58 
 
 		 464 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  63.09 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  62.58 
 
 		 464 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53050  aromatic amino acid transport protein AroP2  64.04 
 
 		 472 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  62.36 
 
 		 464 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  63.31 
 
 		 470 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  63.09 
 
 		 458 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  62.86 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  62.36 
 
 		 464 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  62.36 
 
 		 464 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  61.54 
 
 		 469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3784  amino acid permease-associated region  60.65 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000046446 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  62.64 
 
 		 458 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4495  amino acid ABC transporter permease  61.45 
 
 		 472 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3580  amino acid permease-associated region  61.32 
 
 		 469 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.90045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1493  amino acid permease-associated region  59.62 
 
 		 472 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1417  amino acid permease-associated region  61.45 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3147  amino acid permease-associated region  58.58 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4001  amino acid permease-associated region  62.05 
 
 		 467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.070597  hitchhiker  0.0000638701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2159  aromatic amino acid transport protein AroP1  65.47 
 
 		 469 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0552  amino acid permease-associated region  59.23 
 
 		 445 aa  531  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0642  amino acid permease-associated region  59.43 
 
 		 459 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4796  amino acid permease-associated region  55.99 
 
 		 474 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0905824  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  53.98 
 
 		 462 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  55.48 
 
 		 452 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  47.31 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1513  gamma-aminobutyrate permease  47.65 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  45.37 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  45.86 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  44.1 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  44.1 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  44.1 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  44.1 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  44.32 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  45.08 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  44.1 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  44.2 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  44.1 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  45.08 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>