More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1324 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  100 
 
 		 476 aa  942    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  100 
 
 		 476 aa  942    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  71.34 
 
 		 471 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  81.86 
 
 		 472 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  99.79 
 
 		 476 aa  938    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  96.01 
 
 		 476 aa  884    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  70.26 
 
 		 475 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  69.64 
 
 		 466 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  69.46 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  68.71 
 
 		 468 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  69.65 
 
 		 477 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  65.74 
 
 		 458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  66.24 
 
 		 462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  65.3 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  64.88 
 
 		 459 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  65.23 
 
 		 458 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  65.52 
 
 		 458 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  64.36 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  64.79 
 
 		 459 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  65.3 
 
 		 468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  65.09 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  64.66 
 
 		 459 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  65.83 
 
 		 459 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  57.85 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  47.34 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  48.25 
 
 		 455 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  37.47 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  37.18 
 
 		 485 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  37.18 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  37.31 
 
 		 461 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  37.53 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.14 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.14 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.14 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.14 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.14 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  37.15 
 
 		 460 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 477 aa  316  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  37.31 
 
 		 463 aa  315  9e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  36.66 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  37.31 
 
 		 461 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  37.21 
 
 		 471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  35.78 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  37.25 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  37.25 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  37.25 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  37.09 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  37.09 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  37.09 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  35.78 
 
 		 463 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 		 464 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  35.68 
 
 		 472 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  39.15 
 
 		 468 aa  312  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  36.87 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2854  amino acid permease  36.92 
 
 		 454 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0237037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  38.24 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  38.82 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  38.82 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  38.82 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  36.72 
 
 		 462 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  38.82 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  36.14 
 
 		 472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  35.29 
 
 		 471 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 		 461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  38.24 
 
 		 470 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  38.82 
 
 		 461 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  38.82 
 
 		 461 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  35.29 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  37.14 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1385  amino acid transporter  36.92 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351329  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1516  amino acid permease  36.92 
 
 		 454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1381  amino acid transporter  36.92 
 
 		 454 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.568485  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  37.34 
 
 		 485 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0577  amino acid permease  68.86 
 
 		 224 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0685  amino acid transporter  36.7 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0485493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0467  amino acid transporter  36.7 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00613549  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1774  amino acid permease  36.7 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.186196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  37.36 
 
 		 455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  35.29 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1185  amino acid transporter  36.7 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  35.47 
 
 		 474 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  39.36 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  35.7 
 
 		 473 aa  306  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  39.36 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  39.36 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  35.7 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  35.7 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  39.13 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  35.26 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  34.6 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  39.13 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  39.13 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  35.04 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  39.13 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  34.39 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0705  amino acid permease-associated region  38.36 
 
 		 457 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 455 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  36.59 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  35.48 
 
 		 473 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>