More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0764 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  84.97 
 
 		 459 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  97.16 
 
 		 458 aa  849    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  96.94 
 
 		 458 aa  847    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  85.19 
 
 		 459 aa  751    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  96.72 
 
 		 458 aa  864    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  73.3 
 
 		 471 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  84.97 
 
 		 468 aa  752    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  73.68 
 
 		 466 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  100 
 
 		 459 aa  894    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  72.25 
 
 		 475 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  85.84 
 
 		 468 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  85.62 
 
 		 468 aa  755    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  85.62 
 
 		 459 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  85.62 
 
 		 468 aa  741    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  68.04 
 
 		 472 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  64.18 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  63.91 
 
 		 468 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  64.88 
 
 		 476 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  64.88 
 
 		 476 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  64.81 
 
 		 476 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  64.88 
 
 		 476 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  64.9 
 
 		 462 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  65.85 
 
 		 477 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  55.73 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0577  amino acid permease  97.32 
 
 		 224 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  49.23 
 
 		 488 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  47.93 
 
 		 455 aa  346  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  38.58 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  38.58 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  38.58 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  38.58 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  38.21 
 
 		 471 aa  326  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  38.51 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  38.77 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  37.75 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  37.56 
 
 		 485 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  39.2 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  38.33 
 
 		 471 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  35.28 
 
 		 463 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  37.33 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  36.24 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  37.03 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  37.03 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  37.03 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  37.03 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  37.16 
 
 		 458 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  37.09 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  39.95 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  37.03 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  36.97 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  37.05 
 
 		 458 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  37.05 
 
 		 458 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  37.05 
 
 		 458 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  37.05 
 
 		 458 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.02 
 
 		 463 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  35.73 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.02 
 
 		 463 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.02 
 
 		 463 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.02 
 
 		 463 aa  312  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  36.02 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  37.39 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  37.39 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  37.39 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  36.75 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  39.19 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  39.19 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  35.79 
 
 		 463 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  39.19 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  39.19 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  35.51 
 
 		 463 aa  308  9e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  39.19 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  36.83 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  39.19 
 
 		 461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  39.82 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  39.82 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  35.68 
 
 		 462 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  39.82 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  39.09 
 
 		 472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  39.09 
 
 		 472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  35.31 
 
 		 464 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  39.59 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  39.59 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  39.59 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  39.59 
 
 		 468 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  38.44 
 
 		 472 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  37.55 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  39.09 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  38.9 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0583  amino acid permease-associated region  38.55 
 
 		 495 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0404374 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  37.69 
 
 		 473 aa  302  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  37.34 
 
 		 473 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  35.54 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  37.12 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  37.12 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  35.03 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  36.88 
 
 		 473 aa  299  8e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  37.08 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0369  amino acid permease-associated region  38.67 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>