More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2172 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 477 aa  943    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  70.56 
 
 		 471 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  75.66 
 
 		 462 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  68.86 
 
 		 475 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  70.52 
 
 		 466 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  70.02 
 
 		 472 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  68.71 
 
 		 468 aa  618  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  67.53 
 
 		 468 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  67.72 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  67.72 
 
 		 476 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  67.51 
 
 		 476 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  67.57 
 
 		 476 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  63.82 
 
 		 459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  65.11 
 
 		 458 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  65.85 
 
 		 459 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  64.16 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  63.94 
 
 		 468 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  65.41 
 
 		 458 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  65.19 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  59.24 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  63.94 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  63.72 
 
 		 459 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  63.72 
 
 		 468 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  63.27 
 
 		 459 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  47.24 
 
 		 488 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  51.38 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  38.34 
 
 		 462 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  38.65 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  39.59 
 
 		 472 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  38.5 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  38.03 
 
 		 471 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  39.13 
 
 		 472 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  37.61 
 
 		 471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  36.58 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  41.31 
 
 		 468 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  41.31 
 
 		 468 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  41.31 
 
 		 468 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  35.29 
 
 		 463 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  38.98 
 
 		 485 aa  312  9e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  41.06 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  35.29 
 
 		 463 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  41.06 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  38.8 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  41.06 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  41.06 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  35.07 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  35.07 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  35.07 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  35.07 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  35.07 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  35.14 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  35.07 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  35.07 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  37.58 
 
 		 471 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1317  GABA permease  38.2 
 
 		 465 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.319742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3751  GABA permease  36.56 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00254323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  34.84 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  38.77 
 
 		 475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  39.55 
 
 		 459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  36.23 
 
 		 460 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  36.44 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  36.96 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  36.44 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  36.44 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3774  GABA permease  36.52 
 
 		 464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  34.46 
 
 		 473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3489  GABA permease  36.36 
 
 		 464 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  34.25 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  34.46 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  34.46 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  34.53 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0705  amino acid permease-associated region  38.75 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  35.53 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  34.25 
 
 		 473 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  35.55 
 
 		 475 aa  300  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  34.25 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 472 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3823  GABA permease  35.93 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  34.55 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0369  amino acid permease-associated region  37.39 
 
 		 504 aa  300  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  35.64 
 
 		 474 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  35.53 
 
 		 478 aa  299  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  34.82 
 
 		 474 aa  299  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  34.25 
 
 		 473 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  36.99 
 
 		 467 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  35.42 
 
 		 513 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  37.31 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  35.32 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  34.53 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  34.62 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  37.39 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  34.04 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 		 473 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  36.03 
 
 		 475 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  37.19 
 
 		 463 aa  296  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 476 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>