More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0487 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  100 
 
 		 466 aa  931    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  64.86 
 
 		 524 aa  610  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  57.99 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  54.29 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  54.37 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  53.66 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  53.81 
 
 		 475 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  53.07 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  53.63 
 
 		 470 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  53.24 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  53.54 
 
 		 479 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  53.54 
 
 		 479 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  54.2 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  49.89 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  49.23 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  49.01 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  49.46 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  49.57 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  49.35 
 
 		 474 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  49.57 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  49.14 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  53.64 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  49.46 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  49.46 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  49.56 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  49.23 
 
 		 470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  49.45 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  49.13 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  49.13 
 
 		 474 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  47.68 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  47.68 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  51.73 
 
 		 465 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  51.88 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  47.36 
 
 		 476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  47.47 
 
 		 473 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  47.9 
 
 		 473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  47.68 
 
 		 475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  45.97 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  45.83 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  47.68 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  45.83 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  47.68 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  47.68 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  45.97 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  45.83 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  47.68 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  46.19 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  47.68 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  47.44 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  45.83 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  45.97 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  45.61 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  46.04 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  46.68 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  46.68 
 
 		 471 aa  433  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  47.44 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  42.67 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  44.68 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  44.68 
 
 		 489 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  43.26 
 
 		 488 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  43.03 
 
 		 488 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  43.03 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  43.87 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  42.04 
 
 		 527 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  43.03 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  43.03 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  42.79 
 
 		 488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  42.99 
 
 		 488 aa  352  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  42.99 
 
 		 488 aa  352  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  42.79 
 
 		 488 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  43.03 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  42.48 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  39.75 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  40.57 
 
 		 479 aa  342  7e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  45.01 
 
 		 512 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  44.65 
 
 		 500 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  43.26 
 
 		 526 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  39.83 
 
 		 511 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  39.83 
 
 		 536 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  42.96 
 
 		 526 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  40.84 
 
 		 526 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  40.04 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  40.84 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  40.84 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  41.3 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  41.3 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  41.3 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  41.3 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  41.3 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  43.55 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  41.3 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  43.55 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  41.3 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  41.3 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  43.55 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  43.55 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  43.55 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  43.55 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  41.3 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0412  amino acid transporter  39.18 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000422224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>