More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3470 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  79.87 
 
 		 470 aa  766    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  80.93 
 
 		 475 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  73.84 
 
 		 465 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  80.85 
 
 		 474 aa  756    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  100 
 
 		 469 aa  939    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  78.89 
 
 		 470 aa  764    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  65.41 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  59.68 
 
 		 479 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  59.68 
 
 		 479 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  58.97 
 
 		 467 aa  529  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  53.23 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  54.67 
 
 		 471 aa  522  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  54.67 
 
 		 468 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  53.08 
 
 		 478 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  55.1 
 
 		 485 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  52.68 
 
 		 513 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  53.08 
 
 		 474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  52.65 
 
 		 478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  54.65 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  52.7 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  52.65 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  52.65 
 
 		 474 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  52.92 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  52.52 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  52.7 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  53.66 
 
 		 466 aa  512  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  52.21 
 
 		 473 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  51.75 
 
 		 473 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  51.75 
 
 		 473 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  51.75 
 
 		 473 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  52.99 
 
 		 472 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  51.75 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  52.22 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  51.54 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  54.47 
 
 		 524 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  52.19 
 
 		 473 aa  502  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  53.54 
 
 		 476 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  51.54 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  52.01 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  54.71 
 
 		 458 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  52.01 
 
 		 470 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  52.74 
 
 		 473 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  52.28 
 
 		 475 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  51.97 
 
 		 476 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  52.3 
 
 		 473 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  52.53 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  52.28 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  52.53 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  52.28 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  52.28 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  54.34 
 
 		 458 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  48.22 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  47.56 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  47.33 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  47.54 
 
 		 470 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  48.04 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  40.92 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  38.89 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  39.52 
 
 		 488 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  39.09 
 
 		 488 aa  358  8e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  38.79 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  42.8 
 
 		 500 aa  356  5.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  39.18 
 
 		 488 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  38.33 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  38.33 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  38.36 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  38.36 
 
 		 488 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  38.15 
 
 		 488 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  38.15 
 
 		 488 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  38.2 
 
 		 489 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  41.38 
 
 		 512 aa  342  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  38.2 
 
 		 489 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  40.65 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  40.52 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  40.52 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  40.52 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  40.52 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  40.52 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  40.52 
 
 		 520 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  40.3 
 
 		 520 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 496 aa  339  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61250  APC family lysine-specific permease  41.61 
 
 		 487 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.405295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  37.82 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  40 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  39.58 
 
 		 503 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  39.58 
 
 		 503 aa  336  5e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 538 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  39.58 
 
 		 503 aa  336  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 538 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 511 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5274  lysine-specific permease  40.86 
 
 		 487 aa  336  7e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  38.94 
 
 		 527 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  38.92 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 536 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  40.43 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  40.43 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  40.43 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  40.43 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2396  amino acid transporter  39.14 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 511 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>