More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3087 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 466 aa  932    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  60.55 
 
 		 468 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  60.77 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  61.84 
 
 		 471 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  61.54 
 
 		 475 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  60 
 
 		 466 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  59.4 
 
 		 472 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  59.56 
 
 		 462 aa  527  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  61.69 
 
 		 477 aa  528  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  57.89 
 
 		 476 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  58.37 
 
 		 476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  58.37 
 
 		 476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  58.37 
 
 		 476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  57.14 
 
 		 459 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  56.48 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  56.7 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  56.92 
 
 		 468 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  55.73 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  55.95 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  56.92 
 
 		 468 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  55.95 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  56.7 
 
 		 459 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  56.7 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  56.48 
 
 		 459 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  44.11 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  45.52 
 
 		 455 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  38.61 
 
 		 462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  37.89 
 
 		 471 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  37.39 
 
 		 471 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  39.59 
 
 		 472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  38.96 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  38.96 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  38.51 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  37.47 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  39.42 
 
 		 473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  36.5 
 
 		 464 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  36.96 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  37.39 
 
 		 463 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.88 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.88 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.88 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.88 
 
 		 463 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  36.74 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.88 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  36.96 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  37.14 
 
 		 461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  36.82 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.59 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  37.9 
 
 		 468 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0705  amino acid permease-associated region  37.93 
 
 		 457 aa  302  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  36.58 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  37.14 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  37.21 
 
 		 459 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  37.28 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  37.14 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  36.38 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  36.92 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  37.14 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  40.35 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  40.35 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  40.35 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  36.08 
 
 		 460 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  40.1 
 
 		 468 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  37.89 
 
 		 461 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  40.1 
 
 		 468 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  37.89 
 
 		 461 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  37.89 
 
 		 461 aa  299  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  40.1 
 
 		 468 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  40.1 
 
 		 468 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  37.89 
 
 		 461 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  33.97 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  37.89 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  37.89 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  35.59 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  37.33 
 
 		 469 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  36.08 
 
 		 475 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  34.83 
 
 		 471 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  34.2 
 
 		 468 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  36.53 
 
 		 461 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  34.2 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  36.99 
 
 		 467 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3992  putative transport protein YifK  37.58 
 
 		 482 aa  292  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00908983  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  37.31 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  36.28 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  39.17 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4125  putative transport protein YifK  38.24 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  36.28 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  37.07 
 
 		 485 aa  290  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  36.2 
 
 		 470 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  35.02 
 
 		 474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  36.47 
 
 		 470 aa  289  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4318  putative transport protein YifK  37.75 
 
 		 460 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0011437  normal  0.877333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4141  putative transport protein YifK  37.44 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000118516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4156  putative transport protein YifK  37.44 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000110979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4210  putative transport protein YifK  37.44 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000256233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4259  putative transport protein YifK  37.44 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000481193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>