More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0592 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  65.38 
 
 
473 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  92.37 
 
 
471 aa  886    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  65.4 
 
 
473 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  64.96 
 
 
473 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  65.17 
 
 
473 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  63.69 
 
 
472 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  65.4 
 
 
473 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  92.58 
 
 
471 aa  881    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  65.4 
 
 
473 aa  653    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  64.41 
 
 
472 aa  636    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  92.54 
 
 
468 aa  877    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  100 
 
 
472 aa  947    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  65.25 
 
 
473 aa  650    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  65.38 
 
 
473 aa  653    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  65.19 
 
 
473 aa  650    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  66 
 
 
470 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  61.82 
 
 
513 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  60.55 
 
 
474 aa  622  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  61.39 
 
 
478 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  61.08 
 
 
474 aa  618  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  60.81 
 
 
474 aa  620  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  61.39 
 
 
474 aa  618  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  62.63 
 
 
475 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  64.63 
 
 
475 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  64.63 
 
 
473 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  64.63 
 
 
475 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  62.39 
 
 
476 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  64.25 
 
 
473 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  60.95 
 
 
478 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  64.4 
 
 
473 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  64.4 
 
 
475 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  60.95 
 
 
474 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  60.95 
 
 
474 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  62.63 
 
 
475 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  60.22 
 
 
476 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0831  amino-acid permease RocC  91.58 
 
 
297 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  56.22 
 
 
469 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  54.05 
 
 
470 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  54.05 
 
 
470 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  52.52 
 
 
469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  53.52 
 
 
468 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  54.52 
 
 
468 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  54.52 
 
 
468 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  50.96 
 
 
475 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  51.81 
 
 
474 aa  495  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  52.34 
 
 
485 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  51.66 
 
 
477 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  50.55 
 
 
470 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  50.33 
 
 
470 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  50 
 
 
479 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  50 
 
 
479 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  48.39 
 
 
467 aa  472  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  50.88 
 
 
458 aa  471  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  48.9 
 
 
465 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  51.46 
 
 
524 aa  461  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  50.88 
 
 
458 aa  456  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  47.44 
 
 
466 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  44.74 
 
 
462 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  42.65 
 
 
488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  42.68 
 
 
488 aa  403  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  42.04 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  42.04 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  42.04 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  42.04 
 
 
488 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  42.25 
 
 
488 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  42.04 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  42.68 
 
 
488 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  42.59 
 
 
489 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  42.25 
 
 
488 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  42.86 
 
 
489 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  43.49 
 
 
489 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  41.24 
 
 
488 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2670  lysine transporter  43.21 
 
 
503 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  43.21 
 
 
503 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  43.21 
 
 
503 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  41.81 
 
 
490 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  43.49 
 
 
489 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  42.65 
 
 
489 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  43.49 
 
 
489 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  43.49 
 
 
489 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  43.49 
 
 
489 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0115571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  43.07 
 
 
489 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  43.07 
 
 
489 aa  391  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  41.32 
 
 
520 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  41.3 
 
 
512 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  41.32 
 
 
520 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  43.07 
 
 
489 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  42.71 
 
 
493 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  41.32 
 
 
520 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  43.07 
 
 
489 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  41.32 
 
 
520 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  43.07 
 
 
489 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  43.07 
 
 
489 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  43.07 
 
 
489 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  41.32 
 
 
520 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0199  lysine-specific permease  41.32 
 
 
520 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  43.07 
 
 
489 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  43.07 
 
 
489 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  42.47 
 
 
500 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0464  lysine-specific permease  41.75 
 
 
520 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>