More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31730 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31730  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  100 
 
 		 476 aa  923    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  40.88 
 
 		 466 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  41.52 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  38.43 
 
 		 468 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  38.64 
 
 		 476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  41.96 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  38.25 
 
 		 462 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  38.21 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  39.35 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  41.09 
 
 		 458 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  40.04 
 
 		 475 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  38.9 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  38.9 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  38.9 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  41.09 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  41.09 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  42.28 
 
 		 455 aa  296  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  40.2 
 
 		 477 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  38.66 
 
 		 462 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  37.09 
 
 		 466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0642  amino acid permease-associated region  42.46 
 
 		 459 aa  289  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  37.7 
 
 		 475 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  40.39 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  40.41 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  40.18 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  39.95 
 
 		 488 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  40.2 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2029  amino acid permease-associated region  43.82 
 
 		 461 aa  279  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  41.03 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  41.03 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  41.03 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  41.03 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  41.69 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0163  aromatic amino acid transporter  39.95 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0164  aromatic amino acid transporter  39.95 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0168  aromatic amino acid transporter  39.95 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  42.3 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  40.36 
 
 		 466 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0171  aromatic amino acid transporter  39.95 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  41.09 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3123  amino acid permease-associated region  40.41 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  40.77 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  40.77 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0842  aromatic amino acid/H+ symporter  40.66 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  42.05 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  36.92 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  39.25 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  38.18 
 
 		 467 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0671  amino acid permease-associated region  39.8 
 
 		 453 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  37.79 
 
 		 461 aa  273  7e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  39.59 
 
 		 457 aa  272  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  39.59 
 
 		 457 aa  272  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  39.59 
 
 		 457 aa  272  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  39 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  39 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  39 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  39 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  39 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  39 
 
 		 456 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  39.45 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  39 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0705  amino acid permease-associated region  38.14 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25270  aromatic amino acid transport protein AroP1  38.46 
 
 		 469 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0114  aromatic amino acid transporter  39.43 
 
 		 456 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00114785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  39.1 
 
 		 460 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  36.79 
 
 		 476 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  36.57 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  36.57 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  36.57 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1594  aromatic amino acid transport protein  40.75 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  39.5 
 
 		 462 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3756  amino acid permease-associated region  37.17 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0213954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  35.5 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01910  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  39.12 
 
 		 488 aa  265  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3570  amino acid permease-associated region  36.52 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0500  putative proline-specific permease  36.57 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.968025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1037  aromatic amino acid transporter  38.77 
 
 		 465 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.725191  normal  0.852119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0967  amino acid permease-associated region  39.74 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695825  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4651  aromatic amino acid transport protein AroP2  39.12 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0927  amino acid ABC transporter permease  39.74 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  34.72 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3494  amino acid permease-associated region  38.53 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0905  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3147  amino acid permease-associated region  34.85 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520487  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1513  gamma-aminobutyrate permease  35.83 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  36.48 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3366  aromatic amino acid transport protein AroP  38.53 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0519215  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4502  amino acid permease-associated region  38.07 
 
 		 461 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  36.3 
 
 		 459 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0632  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 		 448 aa  261  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53050  aromatic amino acid transport protein AroP2  39.46 
 
 		 472 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  34.72 
 
 		 461 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0834  amino acid permease-associated region  35.6 
 
 		 460 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4288  amino acid permease-associated region  39.74 
 
 		 451 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  37.8 
 
 		 458 aa  259  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  37.8 
 
 		 458 aa  259  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  37.8 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  37.8 
 
 		 458 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  37.8 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0933  amino acid permease-associated region  39.8 
 
 		 452 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>