More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2029 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2029  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 461 aa  877    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31730  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  44.3 
 
 		 476 aa  345  7e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7638  amino acid transporter  42.16 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1474  amino acid permease-associated region  41.54 
 
 		 466 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5191  amino acid permease  41.83 
 
 		 475 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3209  putative amino acid permease  41.05 
 
 		 468 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0778  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5849  amino acid tranporter  43.18 
 
 		 468 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0897353  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2542  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.072849  hitchhiker  0.000000187345 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2073  amino acid permease-associated region  40.75 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1116  putative amino acid permease  42.51 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00419604  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2975  amino acid permease  41.98 
 
 		 476 aa  320  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0764  amino acid permease  43.62 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37630  putative amino acid permease  39.87 
 
 		 468 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0477097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3100  amino acid permease  41.76 
 
 		 476 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.62868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1324  amino acid transporter  41.76 
 
 		 476 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2283  amino acid permease  41.21 
 
 		 476 aa  315  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2517  amino acid permease-associated region  43.62 
 
 		 468 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0972613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1906  amino acid permease-associated region  43.4 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0961  amino acid permease  42.51 
 
 		 458 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0965  amino acid permease  42.51 
 
 		 458 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.307962  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2565  amino acid permease-associated region  42.95 
 
 		 459 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2435  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 		 459 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0155643  unclonable  0.0000000000341886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2830  amino acid permease-associated region  43.94 
 
 		 488 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.510786  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3087  amino acid permease-associated region  37.44 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0750084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  36.13 
 
 		 462 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2172  amino acid permease-associated region  41.58 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2166  amino acid permease-associated region  38.86 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.187874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  37.34 
 
 		 462 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  37.72 
 
 		 463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  36.34 
 
 		 463 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  36.77 
 
 		 463 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  39.09 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  37.47 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  37.18 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  39.09 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  37.47 
 
 		 467 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  39.09 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  36.34 
 
 		 463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  36.34 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  36.34 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  36.34 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  36.34 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  35.19 
 
 		 464 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  38.86 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  38.86 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  38.86 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  38.86 
 
 		 468 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  36.5 
 
 		 463 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  36.34 
 
 		 463 aa  285  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  36.13 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  35.7 
 
 		 463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  37.92 
 
 		 468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 		 459 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1791  amino acid transporter  36.72 
 
 		 463 aa  281  3e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000626073  hitchhiker  3.07012e-24 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  36.52 
 
 		 460 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0834  amino acid permease-associated region  37.06 
 
 		 460 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0390  amino acid permease-associated region  37.2 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000972649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0905  amino acid permease-associated region  36.62 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0683  amino acid permease-associated region  44.34 
 
 		 455 aa  276  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65026  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  36.96 
 
 		 460 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  36.96 
 
 		 460 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  36.96 
 
 		 460 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0433  amino acid permease-associated region  37.07 
 
 		 467 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  36.6 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  36.44 
 
 		 485 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  35.68 
 
 		 458 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  36.38 
 
 		 461 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  37.67 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5081  amino acid permease-associated region  35.84 
 
 		 467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0324065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  36.59 
 
 		 471 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  36.01 
 
 		 485 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4905  amino acid permease-associated region  36.06 
 
 		 467 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.963785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  35.75 
 
 		 458 aa  269  7e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5031  amino acid ABC transporter permease  36.06 
 
 		 467 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  35.68 
 
 		 470 aa  269  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  37.01 
 
 		 471 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  36.67 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  36.24 
 
 		 455 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  36.67 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  36.67 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  34.82 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1095  amino acid permease-associated region  36.46 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0732  amino acid permease-associated region  36.68 
 
 		 455 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.486551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  35.71 
 
 		 470 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1212  amino acid permease-associated region  36.68 
 
 		 455 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026643  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4318  putative transport protein YifK  36.64 
 
 		 460 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0011437  normal  0.877333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  35.1 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5046  histidine transport protein  36.76 
 
 		 474 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.926717 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  35.46 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0583  amino acid permease-associated region  37.04 
 
 		 495 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0404374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1095  amino acid permease-associated region  36.03 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.212668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  33.91 
 
 		 461 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4156  putative transport protein YifK  36.34 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000110979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4210  putative transport protein YifK  36.34 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000256233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4259  putative transport protein YifK  36.34 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000481193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  37.97 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2854  amino acid permease  36.38 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0237037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4141  putative transport protein YifK  36.34 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000118516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  37.01 
 
 		 470 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>