More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0627 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  100 
 
 		 458 aa  918    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  87.55 
 
 		 458 aa  771    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  60.18 
 
 		 469 aa  551  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  56.07 
 
 		 470 aa  522  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  56.29 
 
 		 470 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  55.07 
 
 		 474 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  53.76 
 
 		 475 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  52.85 
 
 		 472 aa  497  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  53.68 
 
 		 524 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  53.32 
 
 		 472 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  54.71 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  54.3 
 
 		 473 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  53.24 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  54.08 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  54.08 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  53.86 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  53.64 
 
 		 473 aa  488  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  54.08 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  53.86 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  53.91 
 
 		 467 aa  490  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  53.64 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  52.6 
 
 		 479 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  53.64 
 
 		 473 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  52.6 
 
 		 479 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  54 
 
 		 473 aa  481  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  54.46 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  53.51 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  54.23 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  53.74 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  54.23 
 
 		 473 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  54.23 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  53.74 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  54.23 
 
 		 475 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  53.24 
 
 		 485 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  51.32 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  51.1 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  51.32 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  50.88 
 
 		 472 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  51.1 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  51.2 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  51.89 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  50.88 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  50.88 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  50.99 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  51.32 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  50.99 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  50.88 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  52.46 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  50.44 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  50.44 
 
 		 474 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  53.23 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  48.66 
 
 		 468 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  49.11 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  48.66 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  48.89 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  48.89 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  41.58 
 
 		 490 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  38.56 
 
 		 527 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  40.84 
 
 		 488 aa  339  8e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  40.28 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  40.05 
 
 		 488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  39.48 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  40.05 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  40.05 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  38.66 
 
 		 488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2247  amino acid permease-associated region  40.48 
 
 		 496 aa  336  5e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  40.05 
 
 		 488 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  39.26 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  40.05 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  40.05 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  39.81 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  39.58 
 
 		 488 aa  333  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  39.3 
 
 		 489 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  39.3 
 
 		 489 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  39.3 
 
 		 489 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  39.3 
 
 		 489 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  39.53 
 
 		 489 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  39.53 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  39.53 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  38.98 
 
 		 512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  39.53 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  39.53 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2757  lysine transporter  39.32 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  39.53 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  39.53 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  39.53 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  39.53 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  39.4 
 
 		 514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3450  amino acid permease-associated region  40.62 
 
 		 526 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  39.08 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 536 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0379  amino acid transporter  39.96 
 
 		 526 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3806  amino acid permease-associated region  40.35 
 
 		 511 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.742871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3715  amino acid permease-associated region  40.35 
 
 		 538 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4648  amino acid permease-associated region  40.35 
 
 		 538 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5271  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 526 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3096  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 526 aa  326  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4997  amino acid permease-associated region  39.96 
 
 		 526 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>