More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5714 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3727  amino acid transporter  83.66 
 
 		 468 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5714  putative amino acid permease  100 
 
 		 470 aa  931    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2036  amino acid permease-associated region  83.44 
 
 		 468 aa  775    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.790711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2179  amino acid permease-associated region  82.83 
 
 		 468 aa  778    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0711158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65850  amino acid ABC transporter permease  99.15 
 
 		 470 aa  925    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397279  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3034  amino acid permease family protein  54.89 
 
 		 513 aa  532  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000778692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2716  amino acid permease; arginine permease  55.11 
 
 		 474 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000134476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0544  amino acid permease-associated region  53.56 
 
 		 472 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0556  amino acid permease-associated region  53.78 
 
 		 472 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2996  amino acid permease family protein  55.11 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.65935e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2735  amino acid permease; arginine permease  55.11 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.73019e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3032  amino acid permease family protein  54.89 
 
 		 474 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2247  amino acid permease family protein  54.89 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000872443  hitchhiker  0.000241281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2998  amino acid permease family protein  54.77 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000785062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2325  amino acid permease-associated region  54.05 
 
 		 476 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000716314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0711  amino acid ABC transporter, permease protein  53.51 
 
 		 473 aa  521  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00282515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2786  amino acid permease family protein  54.67 
 
 		 478 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000595058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2998  amino acid permease family protein  54.67 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000337351  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0772  amino acid ABC transporter, permease protein  54.22 
 
 		 475 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0773  amino acid permease  53.61 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000509453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0592  amino acid permease-associated region  54.05 
 
 		 472 aa  518  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0554  amino acid ABC transporter permease  54.22 
 
 		 473 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000103812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4599  amino-acid permease RocC  53.61 
 
 		 471 aa  518  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000205089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0738  amino-acid permease RocC  53.61 
 
 		 468 aa  519  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0610  amino acid ABC transporter permease  54.22 
 
 		 475 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4659  amino acid ABC transporter, permease protein  53.54 
 
 		 476 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350234  hitchhiker  4.63253e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0555  amino acid ABC transporter permease  54.22 
 
 		 473 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000183711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0643  amino acid ABC transporter permease  54.22 
 
 		 475 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0679  amino acid ABC transporter, permease protein  54 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.711414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0700  amino acid ABC transporter, permease protein  54 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0547  amino acid permease family protein  50.55 
 
 		 473 aa  498  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0466  amino acid permease family protein  50 
 
 		 473 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0409  amino acid permease; arginine permease  50 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0405  amino acid permease  50 
 
 		 473 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4826  amino acid permease family protein  50.55 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0332094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0492  amino acid permease family protein  50 
 
 		 473 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0496  amino acid permease family protein  50.11 
 
 		 473 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0547  amino acid permease family protein  50.33 
 
 		 473 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000141455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0411  amino acid permease-associated region  49.34 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1042  amino acid permease-associated region  51.76 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0507  amino acid transporter  50.64 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.229334  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  49.23 
 
 		 466 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5465  amino acid permease-associated region  46.52 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  hitchhiker  0.00900636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0694  amino acid permease-associated region  48.47 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0660  amino acid transporter  48.47 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0232507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1143  amino acid permease-associated region  50.33 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00088107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0827  S-methylmethionine transporter  48.37 
 
 		 474 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3470  S-methylmethionine transporter  47.54 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0627  amino acid transporter  48.89 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3345  amino acid permease-associated region  47.28 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2927  S-methylmethionine transporter  47.32 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3559  amino acid permease-associated region  50.22 
 
 		 485 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1534  S-methylmethionine transporter  46.74 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1041  amino acid permease-associated region  47.1 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000184403  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1306  amino acid permease  47.68 
 
 		 458 aa  428  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000234157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01794  S-methylmethionine transporter  46.09 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1932  amino acid permease-associated region  46.76 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00030899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0325  amino acid permease-associated region  42.48 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3635  amino acid permease-associated region  45.41 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2862  lysine-specific permease  44.18 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.456947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2834  lysine specific permease  44.42 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2794  lysine specific permease  44.42 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.689488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3085  lysine-specific permease  44.42 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3076  lysine-specific permease  44.18 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2051  amino acid permease-associated region  44.29 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3104  lysine-specific permease  44.18 
 
 		 488 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3071  lysine-specific permease  44.12 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3102  lysine-specific permease  43.94 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00351231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2176  lysine-specific permease  44.12 
 
 		 488 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2291  lysine transporter  44.07 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02085  lysine transporter  44.07 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0635265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1502  amino acid permease-associated region  44.07 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000366881  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0810  lysine transporter  44.07 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2453  lysine transporter  44.07 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1492  lysine transporter  44.07 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2856  amino acid permease-associated region  44.36 
 
 		 488 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0658699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2303  lysine transporter  44.07 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3292  lysine transporter  44.07 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0579936  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02044  hypothetical protein  44.07 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0708606  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00990  amino acid transporter  44.05 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2346  lysine transporter  43.17 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00075881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2549  lysine transporter  43.17 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1758  lysine-specific permease transmembrane protein  44.59 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101162  normal  0.222113 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5011  amino acid permease-associated region  44.21 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2435  lysine transporter  43.17 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2439  lysine transporter  43.17 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  44.23 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2391  lysine transporter  43.17 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2594  lysine-specific permease  46.19 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2752  lysine transporter  43.76 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970075  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0172  lysine-specific permease  46.19 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2505  amino acid transporter  39.75 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1010  lysine-specific permease  46.19 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3599  amino acid permease-associated region  45.95 
 
 		 511 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1344  lysine-specific permease  46.19 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3224  lysine transporter  44.74 
 
 		 493 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000298398 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2737  lysine-specific permease  46.19 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4631  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 526 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5455  amino acid permease-associated region  45.95 
 
 		 536 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402528  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1537  lysine transporter  43.76 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.807023  normal  0.123045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>