More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0544 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  100 
 
 		 482 aa  947    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  98.13 
 
 		 482 aa  936    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  97.3 
 
 		 482 aa  929    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  84.85 
 
 		 482 aa  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  73.99 
 
 		 480 aa  693    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  85.48 
 
 		 482 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  100 
 
 		 482 aa  947    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  66.16 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  66.16 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  66.16 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  65.47 
 
 		 486 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  61.36 
 
 		 483 aa  567  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  61.7 
 
 		 479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  60.08 
 
 		 486 aa  561  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  64.27 
 
 		 471 aa  551  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  63.06 
 
 		 469 aa  545  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  62.31 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  63.37 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  61.75 
 
 		 479 aa  533  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  66.37 
 
 		 490 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  54.88 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  55.53 
 
 		 467 aa  498  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  56.25 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  50.44 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  43.03 
 
 		 499 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  43.09 
 
 		 505 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 509 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 509 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 509 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  45.3 
 
 		 485 aa  308  9e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  40.73 
 
 		 500 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 497 aa  282  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  38.48 
 
 		 467 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  40 
 
 		 467 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  38.7 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  38.08 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  39.81 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  39.81 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  39.81 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  39.81 
 
 		 469 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  39.81 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  39.81 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  39.81 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  39.81 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  40.2 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  37.56 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  40.2 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  40.2 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  37.36 
 
 		 461 aa  243  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4353  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  39.86 
 
 		 474 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  39.04 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  39.04 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  35.84 
 
 		 441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  38.82 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  38.24 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  38.83 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  38.96 
 
 		 477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  37.83 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  38.35 
 
 		 458 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  38.69 
 
 		 456 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  38.69 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  40.52 
 
 		 469 aa  231  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  37.24 
 
 		 470 aa  229  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  38.93 
 
 		 454 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  39.74 
 
 		 455 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  37.99 
 
 		 463 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  36.06 
 
 		 455 aa  224  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  36.28 
 
 		 455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  36.36 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  37.64 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  38.22 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  39.85 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  39.74 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  37.35 
 
 		 495 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  40.6 
 
 		 473 aa  206  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  33.16 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  30.36 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.58 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.82 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.58 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  27.34 
 
 		 467 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  27.34 
 
 		 467 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.58 
 
 		 467 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 476 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  27.34 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.58 
 
 		 467 aa  123  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.73 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  29.1 
 
 		 468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 516 aa  119  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 		 476 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 468 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 		 465 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.21 
 
 		 476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>