More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0216 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2628  amino acid permease-associated region  83.22 
 
 		 474 aa  758    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0216  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 483 aa  959    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3297  amino acid permease-associated region  70.75 
 
 		 465 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2522  amino acid permease-associated region  59.24 
 
 		 483 aa  547  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0242402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0847  monomethylamine permease  45.08 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0838  amino acid transporter  44.27 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0101004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1294  ethanolamine transproter  31.31 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  29.8 
 
 		 470 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  27.6 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  27.6 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  27.6 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  29.35 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  27.81 
 
 		 470 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  29.4 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  27.71 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  28.74 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  28.74 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  28.74 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  28.74 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  28.74 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  28.6 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  28.74 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  28.74 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  28.74 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2262  putative transport protein  28.82 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  28.71 
 
 		 467 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1030  amino acid permease-associated region  29.02 
 
 		 474 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0422459  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  27.46 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2625  ethanolamine transproter  29.6 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  31.26 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4821  ethanolamine transproter  28.54 
 
 		 445 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  30.62 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0718  ethanolamine transproter  29.61 
 
 		 458 aa  144  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.871129  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0731  ethanolamine transproter  29.37 
 
 		 458 aa  143  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1379  ethanolamine transporter  26.29 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000712  probable transport protein  27.38 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.234899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3197  ethanolamine permease  31.36 
 
 		 480 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0278  ethanolamine transproter  27.57 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3275  ethanolamine transproter  29.05 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2980  ethanolamine permease  27.84 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391636  normal  0.129971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2416  ethanolamine permease, putative  28.39 
 
 		 455 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.452743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2075  ethanolamine transproter  32.01 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8502  ethanolamine transproter  28.77 
 
 		 457 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2414  ethanolamine transproter  29.4 
 
 		 477 aa  134  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.195094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2299  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 463 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  28.47 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1638  ethanolamine transproter  28.97 
 
 		 483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  28.64 
 
 		 482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4773  ethanolamine transproter  27.61 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  28.15 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11790  putative amino acid transporter  29.64 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0380626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1083  ethanolamine permease  29.05 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3196  ethanolamine transproter  28.74 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0275904  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  28.73 
 
 		 467 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  28.73 
 
 		 467 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  28.73 
 
 		 467 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2100  ethanolamine transproter  29.15 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00738274  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4034  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.880837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4990  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  29.86 
 
 		 482 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0475  ethanolamine transproter  29.37 
 
 		 468 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0941613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  29.86 
 
 		 482 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  29.41 
 
 		 482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0380  ethanolamine transproter  28.23 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4032  amino acid permease-associated region  26.84 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182943  decreased coverage  0.00720195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1835  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355552  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1848  ethanolamine transporter  29.69 
 
 		 479 aa  120  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.079886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2026  ethanolamine permease family protein  27.47 
 
 		 454 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0304  ethanolamine transproter  27.75 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2039  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2056  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3632  ethanolamine transproter  29.43 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0702672  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2102  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0313964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1967  ethanolamine transproter  28.67 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.536053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0068  ethanolamine transproter  26.32 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.23 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3442  ethanolamine transproter  29 
 
 		 469 aa  107  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.477393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.71 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4336  ethanolamine transproter  28.37 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0774  ethanolamine transporter  29.05 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.886156 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 466 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2931  ethanolamine transproter  26.42 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  27.43 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 501 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4842  ethanolamine transproter  29.5 
 
 		 490 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 476 aa  97.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.71 
 
 		 517 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.99 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  23.67 
 
 		 549 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  26.61 
 
 		 753 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 518 aa  92.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 501 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 496 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 465 aa  90.9  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 496 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  25.36 
 
 		 488 aa  90.5  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  22.69 
 
 		 481 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  22.95 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>