255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2950 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2950  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 446 aa  850    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3628  amino acid permease-associated region  33.04 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0216895  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0458  amino acid permease-associated region  24.05 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  26.61 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0306  amino acid permease  26.35 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  26.49 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02690  putative amino acid permease  26.62 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.101126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  24.5 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 716 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  24.94 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  23.59 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3283  ethanolamine transporter  25 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0128  ethanolamine transproter  24.72 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0126  ethanolamine transproter  24.84 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.921777 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  23.24 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  23.24 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2981  ethanolamine permease, putative  25.71 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3045  putative ethanolamine permease  25.71 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0118  ethanolamine transproter  25.5 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3325  putative ethanolamine permease  25.71 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1557  putative ethanolamine permease  25.71 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1837  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367769  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0142  ethanolamine permease  25.71 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.584841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3940  putative ethanolamine permease  25.71 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.867607  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  25.42 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4012  putative ethanolamine permease  25.28 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.25 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.43 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  26.33 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  23.8 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3822  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  23.8 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  25.81 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0142  ethanolamine transproter  24.06 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  23.8 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3308  putative amino acid transporter  25.19 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4445  ethanolamine transporter, EAT family, APC superfamily  24.1 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.697181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0020  ethanolamine transproter  23.87 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2927  ethanolamine permease  23.84 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0128  ethanolamine transproter  23.84 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0006  ethanolamine transproter  23.67 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56424  hitchhiker  0.00761028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1827  amino acid transporter  25.93 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4031  amino acid permease-associated region  22.5 
 
 		 475 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2418  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112494  normal  0.0680601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  26.41 
 
 		 786 aa  55.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3470  amino acid permease  30.82 
 
 		 499 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.202942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3375  transporter  30.82 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.635182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3296  transpoter  30.82 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  23.94 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3368  transporter  30.82 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5504  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 500 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  25.6 
 
 		 641 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3301  transpoter  30.82 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0585  amino acid permease-associated protein  25.86 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.21992  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4686  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 		 500 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3588  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 494 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4162  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 500 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.966406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  28.22 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4779  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 494 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0935  amino acid transporter  28.09 
 
 		 500 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2468  amino acid permease  26.38 
 
 		 496 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.205588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 468 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  24.1 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  24.23 
 
 		 465 aa  53.5  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.7 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1760  amino acid permease-associated region  25.59 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.92 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  24.62 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  26.74 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  23.12 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1399  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  22.12 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0691  ethanolamine transproter  25.19 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1363  amino acid permease  26.38 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  24.92 
 
 		 471 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0244  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.912876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0626  amino acid permease  25.77 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1276  amino acid transporters  25.77 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104597  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1203  amino acid permease  26.83 
 
 		 496 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>