More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0240 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 439 aa  833    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  66.13 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  67.44 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  67.21 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  67.21 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  67.42 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  60.81 
 
 		 438 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  62.59 
 
 		 451 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  59.91 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  53.74 
 
 		 452 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  68.6 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  61.24 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  52.96 
 
 		 455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  52.48 
 
 		 475 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  47.73 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  51.22 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  48.01 
 
 		 454 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  46.9 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  49.88 
 
 		 506 aa  342  8e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  43.79 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  47.62 
 
 		 461 aa  315  9e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  45.93 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  42.76 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  40.62 
 
 		 472 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  43.27 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  42.16 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  42.16 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  41.94 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  42.61 
 
 		 493 aa  283  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 502 aa  282  9e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  42.02 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  41.14 
 
 		 487 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  40.35 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  41.53 
 
 		 473 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  41.57 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  35.99 
 
 		 439 aa  236  7e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  37.75 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  35.27 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  37.09 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  36.81 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  34.72 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  34.41 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  29.01 
 
 		 467 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  29.01 
 
 		 467 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  29.01 
 
 		 467 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  29.01 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  29.01 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  28.79 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  29.18 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  33.02 
 
 		 445 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.01 
 
 		 467 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  31.76 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  29.23 
 
 		 467 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 476 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 486 aa  142  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.3 
 
 		 500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  29.53 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 467 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 495 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  30.73 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.79 
 
 		 467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.52 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.52 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.52 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.52 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.52 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.52 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.52 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.69 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 471 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  32.48 
 
 		 413 aa  133  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  26.12 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  29.49 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 		 495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  26.56 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  27.07 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.82 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.82 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  31.91 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 465 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  28.4 
 
 		 520 aa  126  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  30.35 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 503 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  25.89 
 
 		 469 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.38 
 
 		 471 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.38 
 
 		 471 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  25.9 
 
 		 463 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>