More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3324 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  100 
 
 
451 aa  861    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  64.43 
 
 
452 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  62.68 
 
 
438 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  66.89 
 
 
454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  63.92 
 
 
451 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  63.92 
 
 
451 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  63.17 
 
 
451 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  62.59 
 
 
439 aa  428  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  58.89 
 
 
437 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  68.93 
 
 
449 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  60.34 
 
 
433 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  51.9 
 
 
475 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  50.62 
 
 
455 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  47.48 
 
 
452 aa  362  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  48.03 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  50.62 
 
 
446 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  49.26 
 
 
506 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  42.18 
 
 
454 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  43.16 
 
 
482 aa  303  5.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  43.06 
 
 
483 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  42.95 
 
 
483 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  43.24 
 
 
472 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  41.89 
 
 
502 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  43.72 
 
 
474 aa  293  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  43.89 
 
 
473 aa  292  7e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  46.63 
 
 
461 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  40.17 
 
 
472 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  42.51 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  39 
 
 
461 aa  270  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  42.57 
 
 
479 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  38.88 
 
 
487 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  41.69 
 
 
470 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  41.69 
 
 
470 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  41.46 
 
 
470 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  42.99 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  34.62 
 
 
439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  33.5 
 
 
418 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  39.09 
 
 
436 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  34.88 
 
 
394 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  32.32 
 
 
394 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  35.71 
 
 
412 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  35.04 
 
 
411 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  29.4 
 
 
422 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  34.82 
 
 
413 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  34.06 
 
 
425 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  30.86 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  30.86 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  30.86 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  30 
 
 
468 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 
466 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  29.23 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  29.17 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  29.17 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  29.17 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  29.23 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.95 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  29.12 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  35.17 
 
 
445 aa  127  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 
485 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  29.89 
 
 
467 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 
500 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  29.04 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 
495 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 
467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  29.23 
 
 
467 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  29.62 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  27.91 
 
 
467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 
494 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 
471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  28.04 
 
 
467 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  28.79 
 
 
538 aa  117  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  28.04 
 
 
467 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  28.04 
 
 
467 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  28.17 
 
 
471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  28.04 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  28.04 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.55 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 
520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  27.6 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  28.04 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  28.04 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  24.38 
 
 
478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.47 
 
 
471 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.47 
 
 
471 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  27.47 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  27.47 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  27.47 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  27.47 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  27.47 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 
476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  31.17 
 
 
455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.47 
 
 
471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 
515 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 
438 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  29.31 
 
 
466 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 
486 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.29 
 
 
500 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  30.82 
 
 
504 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>