More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5562 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 451 aa  876    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  98.89 
 
 		 451 aa  866    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  98.89 
 
 		 451 aa  866    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  80.15 
 
 		 452 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  67.44 
 
 		 439 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  62.8 
 
 		 438 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  63.21 
 
 		 437 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  67.51 
 
 		 454 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  68.52 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  63.17 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  51.42 
 
 		 475 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  58.25 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  48.18 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  49.32 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  48.75 
 
 		 455 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  46.19 
 
 		 446 aa  359  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  45.08 
 
 		 474 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  43.25 
 
 		 454 aa  332  9e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  47.97 
 
 		 506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  44.52 
 
 		 472 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  43.35 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  42.4 
 
 		 483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  46.39 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  42.63 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  40.76 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  40.59 
 
 		 473 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  42.05 
 
 		 470 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  42.05 
 
 		 470 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  41.74 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  41.83 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  40.82 
 
 		 493 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  43.44 
 
 		 487 aa  269  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  39.39 
 
 		 502 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  39.37 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 478 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  34.07 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  33.65 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  35.67 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  33.99 
 
 		 394 aa  183  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  33.25 
 
 		 412 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  32.35 
 
 		 422 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  33.42 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  34.24 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  33.85 
 
 		 425 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.76 
 
 		 489 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  30.09 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.09 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.09 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.09 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.87 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.87 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 495 aa  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.64 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.98 
 
 		 467 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 		 520 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.64 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.09 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 466 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  29.27 
 
 		 500 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.5 
 
 		 468 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.74 
 
 		 466 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  28.42 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.64 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 496 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  26.76 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.21 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.08 
 
 		 506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 537 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  30.02 
 
 		 792 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 495 aa  109  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  27.49 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.46 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.1 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  26.68 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.1 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  30.02 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.87 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.87 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  29.29 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 485 aa  107  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 518 aa  106  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 481 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>