More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  100 
 
 		 454 aa  867    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  66.98 
 
 		 452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  65.35 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  67.42 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  67.51 
 
 		 451 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  67.51 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  67.51 
 
 		 451 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  68.16 
 
 		 451 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  63.27 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  69.2 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  52.12 
 
 		 475 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  51.04 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  51.84 
 
 		 455 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  59.61 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  52.82 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  46.77 
 
 		 446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  46.44 
 
 		 454 aa  352  7e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  52.16 
 
 		 506 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  46.54 
 
 		 482 aa  335  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  45.07 
 
 		 472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  45.98 
 
 		 474 aa  326  5e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  43.59 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  45.52 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  46.91 
 
 		 461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  43.31 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  42.39 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  44.47 
 
 		 473 aa  286  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  40.99 
 
 		 472 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  42.36 
 
 		 487 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  43.72 
 
 		 470 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  43.72 
 
 		 470 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  43.5 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  40.22 
 
 		 461 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  43.11 
 
 		 478 aa  259  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  33.8 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  36.13 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  33.1 
 
 		 418 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  36.76 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  36.76 
 
 		 394 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  31.01 
 
 		 422 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  34.54 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  35.56 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  32.84 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  33.6 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.07 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  31.68 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.02 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.02 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.51 
 
 		 495 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.02 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  27.8 
 
 		 467 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.72 
 
 		 467 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  27.8 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  28.41 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  27.8 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 495 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.66 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  27.49 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 494 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  29.45 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  29.35 
 
 		 468 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  27.51 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 520 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  25.65 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  28.16 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  29.93 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.64 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  27.54 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.33 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 459 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  27.54 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.99 
 
 		 471 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  23.85 
 
 		 480 aa  106  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  26.61 
 
 		 450 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  27.73 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  27.29 
 
 		 467 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  27.5 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  29.44 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>