More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2793 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 438 aa  848    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  65.16 
 
 		 452 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  65.65 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  63.27 
 
 		 451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  63.27 
 
 		 451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  62.8 
 
 		 451 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  65.12 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  62.68 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  67.21 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  60.81 
 
 		 439 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  57.73 
 
 		 433 aa  395  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  47.8 
 
 		 455 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  47.41 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  48.6 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  49.39 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  44.52 
 
 		 446 aa  349  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  48.23 
 
 		 506 aa  319  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  44.07 
 
 		 472 aa  316  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  45.37 
 
 		 483 aa  315  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  44.02 
 
 		 454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  44.6 
 
 		 482 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  44.15 
 
 		 461 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  42.33 
 
 		 483 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  40.05 
 
 		 474 aa  293  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  40.27 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  41 
 
 		 479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  40.53 
 
 		 487 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  39.69 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  40.94 
 
 		 493 aa  273  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  39.59 
 
 		 472 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  40.22 
 
 		 470 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  40.22 
 
 		 470 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  40.22 
 
 		 470 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  42.36 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  40.9 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  33.17 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  34.66 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  37.24 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  36.45 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  36.45 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  33.58 
 
 		 422 aa  179  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  34.47 
 
 		 412 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  32.99 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  30.98 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.45 
 
 		 489 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  32.92 
 
 		 413 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  28.64 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  28.19 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  28.19 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  28.15 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  28.57 
 
 		 467 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  28.19 
 
 		 467 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  28.57 
 
 		 467 aa  126  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.9 
 
 		 495 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  27.74 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 500 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  32.99 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  28.19 
 
 		 467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  28.19 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 		 485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2011  putative cationic amino acid transporter  29.06 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  26.85 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  28.95 
 
 		 504 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  27.01 
 
 		 495 aa  116  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  27.48 
 
 		 495 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.4 
 
 		 518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  26.89 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  26.78 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  27.49 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  27.42 
 
 		 466 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  27.15 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  26.57 
 
 		 495 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 466 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  25.69 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 538 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  27.29 
 
 		 471 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  27.64 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  26.57 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  28.25 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>