More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0059 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 493 aa  977    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  70.06 
 
 		 487 aa  599  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  63.06 
 
 		 483 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  62.7 
 
 		 483 aa  535  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  58.35 
 
 		 502 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  63.27 
 
 		 479 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  57.42 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  61.7 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  61.7 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  61.7 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  59.18 
 
 		 473 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  58.26 
 
 		 482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  58.8 
 
 		 474 aa  465  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  60.47 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  55.94 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  53.29 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  52.74 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  52.34 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  55.61 
 
 		 461 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  47.16 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  47.05 
 
 		 455 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  43.47 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  47.73 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  44.5 
 
 		 506 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  41.47 
 
 		 437 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  44.31 
 
 		 452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  42.06 
 
 		 451 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  41.83 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  40.6 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  40.6 
 
 		 451 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  40.6 
 
 		 451 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  41.74 
 
 		 439 aa  246  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  42.17 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  42.67 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  33.75 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  31.37 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  31.67 
 
 		 418 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  32.82 
 
 		 411 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  33.04 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  32.23 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  30.07 
 
 		 412 aa  146  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  31.83 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  30.75 
 
 		 425 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  33.98 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 538 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.18 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.18 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.8 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  29.57 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.51 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 495 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 496 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 496 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  28.1 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  27.17 
 
 		 489 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 500 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  29.02 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 506 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.4 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 		 518 aa  103  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.4 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.28 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.71 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 		 468 aa  101  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 468 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 		 466 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 495 aa  99.8  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.46 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.46 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.64 
 
 		 490 aa  98.6  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.65 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.81 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 476 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 		 501 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  25.58 
 
 		 476 aa  97.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  25.58 
 
 		 476 aa  97.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  25.33 
 
 		 566 aa  96.7  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 485 aa  96.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  26.14 
 
 		 438 aa  96.3  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 475 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  28.27 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.6 
 
 		 764 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  26.89 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>