More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5147 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 478 aa  936    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  71.15 
 
 		 483 aa  643    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  79.61 
 
 		 470 aa  685    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  79.4 
 
 		 470 aa  684    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  86.64 
 
 		 479 aa  777    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  79.4 
 
 		 470 aa  684    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  67.85 
 
 		 483 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  61.57 
 
 		 474 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  60.26 
 
 		 461 aa  498  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  59.83 
 
 		 473 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  61.28 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  61.17 
 
 		 487 aa  485  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  56.06 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  56.93 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  53.76 
 
 		 472 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  51 
 
 		 446 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  52.9 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  54.83 
 
 		 461 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  53.15 
 
 		 472 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  50 
 
 		 452 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  51.43 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  47.15 
 
 		 475 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  47.42 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  41.53 
 
 		 437 aa  286  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  42.3 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  43.88 
 
 		 506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  41.59 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  43.99 
 
 		 451 aa  269  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  40.49 
 
 		 451 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  40.44 
 
 		 451 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  40.44 
 
 		 451 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  44.23 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  41.22 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  43.41 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  42.89 
 
 		 454 aa  236  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  34.88 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  32.79 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.73 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  32.78 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  31.87 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  31.2 
 
 		 394 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  31.3 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  32.87 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  32.03 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  31.13 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  34.88 
 
 		 445 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.5 
 
 		 500 aa  118  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  27.63 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.73 
 
 		 489 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  27.51 
 
 		 471 aa  113  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  27.51 
 
 		 471 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 486 aa  113  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  25.78 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 494 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  24.69 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 476 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  24.38 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.87 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.87 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  26.27 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  24.79 
 
 		 486 aa  106  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  25.33 
 
 		 486 aa  106  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  25.33 
 
 		 486 aa  106  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 520 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 764 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 		 506 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  28.31 
 
 		 786 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  23.6 
 
 		 549 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.51 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 495 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  30.38 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 501 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 515 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.29 
 
 		 491 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  25.1 
 
 		 496 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 494 aa  103  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 465 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  23.46 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  25.97 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  25.47 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 510 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  24.68 
 
 		 476 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  25.11 
 
 		 454 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  25.49 
 
 		 474 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 539 aa  100  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 468 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 468 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 491 aa  99.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.79 
 
 		 468 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.49 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.49 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  25.49 
 
 		 467 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.44 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  24.04 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>