More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2340 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2340  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 506 aa  976    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  58.54 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  57.73 
 
 		 452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  54.87 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  52.82 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  49.54 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1097  amino acid permease-associated region  52.66 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.253911  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  52.5 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  50.47 
 
 		 472 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05480  amino acid transporter  49.14 
 
 		 454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  49.4 
 
 		 461 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  49.61 
 
 		 437 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5270  amino acid permease-associated region  45.71 
 
 		 451 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5181  amino acid permease-associated region  45.71 
 
 		 451 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215843  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  49.31 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5562  amino acid permease-associated region  45.47 
 
 		 451 aa  322  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0009  amino acid permease-associated region  45.03 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  46.33 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5386  amino acid permease-associated region  44.52 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3324  amino acid permease-associated region  47.33 
 
 		 451 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3097  amino acid permease-associated region  43.7 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2793  amino acid permease-associated region  44.87 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3914  amino acid permease-associated region  44.2 
 
 		 472 aa  312  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30460  amino acid transporter  43.81 
 
 		 482 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  44.14 
 
 		 461 aa  295  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4656  amino acid permease-associated region  43.86 
 
 		 470 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.465533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4951  amino acid permease-associated region  43.96 
 
 		 470 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0545959  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4568  amino acid permease-associated region  43.86 
 
 		 470 aa  289  8e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4334  amino acid permease-associated region  45.01 
 
 		 487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.313346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  44.39 
 
 		 493 aa  287  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0993  amino acid permease-associated region  42.92 
 
 		 473 aa  286  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  43.08 
 
 		 479 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0084  amino acid permease-associated region  49.18 
 
 		 449 aa  279  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.687355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  48.74 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5147  amino acid permease-associated region  43.17 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  34.9 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  31.97 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  35.97 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  35.2 
 
 		 394 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  35.51 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  33.08 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  34.19 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  34.81 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  34.5 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  32.23 
 
 		 411 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 		 494 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 538 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 500 aa  116  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.36 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  26.15 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0053  amino acid permease-associated region  31.88 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 468 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  29.55 
 
 		 464 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  28.32 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  28.32 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 491 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  29.39 
 
 		 469 aa  101  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.24 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  24.34 
 
 		 471 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  24.34 
 
 		 471 aa  99.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  24.34 
 
 		 471 aa  99.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  24.34 
 
 		 471 aa  99.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.24 
 
 		 471 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  24.34 
 
 		 471 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  26.71 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  27.99 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  28.38 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  26.71 
 
 		 471 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  24.35 
 
 		 471 aa  98.6  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.41 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  26.48 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  26.48 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  26.76 
 
 		 483 aa  97.4  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 471 aa  97.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.26 
 
 		 486 aa  96.7  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.26 
 
 		 486 aa  96.7  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 488 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  28.63 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  27.31 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  24.13 
 
 		 471 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  27.76 
 
 		 580 aa  94.4  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.7 
 
 		 542 aa  94  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.99 
 
 		 486 aa  94  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.03 
 
 		 481 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 770 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  27.62 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  29 
 
 		 455 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  24.63 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.17 
 
 		 489 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1640  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000819091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>