More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0441 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  100 
 
 
740 aa  1461    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  45.53 
 
 
716 aa  590  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  47.11 
 
 
725 aa  544  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  39.77 
 
 
773 aa  508  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  32.14 
 
 
753 aa  355  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  33.43 
 
 
764 aa  354  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  33.83 
 
 
770 aa  336  7.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  43.78 
 
 
465 aa  330  6e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  34.83 
 
 
786 aa  326  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  31.76 
 
 
820 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  42.37 
 
 
641 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  31.7 
 
 
745 aa  273  8.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  31.69 
 
 
792 aa  248  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1073  amino acid permease-associated region  38.75 
 
 
475 aa  247  6e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00231031  normal  0.0754239 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  37.35 
 
 
473 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1577  amino acid permease-associated region  39.4 
 
 
479 aa  233  9e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  34.98 
 
 
474 aa  221  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  30.34 
 
 
518 aa  154  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  30.91 
 
 
486 aa  153  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1584  amino acid permease-associated region  26.99 
 
 
796 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  29.76 
 
 
460 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 
496 aa  150  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  30.04 
 
 
496 aa  150  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 
476 aa  148  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  28.86 
 
 
456 aa  147  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 
506 aa  146  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.64 
 
 
476 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  30.38 
 
 
489 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.48 
 
 
471 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  30.39 
 
 
496 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.48 
 
 
471 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.48 
 
 
471 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  28.7 
 
 
471 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  28.48 
 
 
471 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  31.57 
 
 
485 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 
476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  28.85 
 
 
471 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  29.27 
 
 
471 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  28.85 
 
 
471 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 
466 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 
466 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  29.02 
 
 
471 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  29.02 
 
 
471 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  29.02 
 
 
471 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  29.02 
 
 
471 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  29.02 
 
 
471 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  27.61 
 
 
462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  30.02 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  29.51 
 
 
471 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  29.84 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  29.58 
 
 
471 aa  138  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  28.41 
 
 
471 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  29.32 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 
466 aa  137  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  30.26 
 
 
466 aa  137  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  27.84 
 
 
462 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  27.84 
 
 
462 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  27.84 
 
 
445 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 
445 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  27.84 
 
 
445 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  29.02 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  27.84 
 
 
445 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  27.84 
 
 
445 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  25.96 
 
 
467 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  29.51 
 
 
481 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  31.96 
 
 
488 aa  134  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  29.07 
 
 
431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  30.24 
 
 
467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 
491 aa  132  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.81 
 
 
467 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  27.54 
 
 
549 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  30.02 
 
 
467 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.57 
 
 
467 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  30.02 
 
 
467 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  30.02 
 
 
467 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.57 
 
 
467 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.57 
 
 
467 aa  131  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.57 
 
 
467 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.57 
 
 
467 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.96 
 
 
467 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  29.8 
 
 
467 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  29.8 
 
 
467 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  29.8 
 
 
467 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  29.8 
 
 
467 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  28.19 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  28.19 
 
 
463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0272  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 
478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.656438  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  29.13 
 
 
476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  30.11 
 
 
463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 
494 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 
501 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  28.37 
 
 
431 aa  127  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  28.23 
 
 
469 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.15 
 
 
495 aa  127  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  28.43 
 
 
517 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03227  amino acid transporter  28.32 
 
 
543 aa  126  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.85 
 
 
467 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>