More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05335 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  100 
 
 		 420 aa  837    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  77.62 
 
 		 420 aa  671    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  70.59 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  46.43 
 
 		 416 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  46.43 
 
 		 416 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  46.43 
 
 		 416 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  45.67 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  45.95 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  46.52 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  45.67 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  45.67 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  45.67 
 
 		 418 aa  323  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  46.29 
 
 		 418 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  46.29 
 
 		 418 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  45.67 
 
 		 418 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  46.29 
 
 		 418 aa  322  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  44.63 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  44.47 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  44.06 
 
 		 417 aa  316  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  44.78 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  44.15 
 
 		 417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  43.24 
 
 		 420 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  43.24 
 
 		 420 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  43.24 
 
 		 420 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  43.24 
 
 		 420 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  43.42 
 
 		 420 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  45.04 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  33.81 
 
 		 425 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  32.94 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  32.94 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  32.94 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  32.94 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  34.27 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  32.85 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  33.25 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  32.38 
 
 		 422 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  32.7 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  32.38 
 
 		 422 aa  209  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  33.49 
 
 		 419 aa  209  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  31.75 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  32.78 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  32.62 
 
 		 421 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  28.61 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  28.61 
 
 		 431 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  28.5 
 
 		 426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 430 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  25.2 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  25.2 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  25.73 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  25.2 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  25.2 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  23.04 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  26.95 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  28 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  27.73 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  27.73 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  27.73 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  27.73 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  27.47 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  27.47 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  26.81 
 
 		 442 aa  99.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  27.39 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 424 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  31.34 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  27.89 
 
 		 424 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  26.41 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  26.41 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  26.41 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  26.41 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  27.66 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  28.12 
 
 		 509 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  26.41 
 
 		 445 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  25.82 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  25.82 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  25.82 
 
 		 444 aa  93.2  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  23.61 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  28.03 
 
 		 508 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  28.3 
 
 		 508 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  24.87 
 
 		 716 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  29.06 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  27.92 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  28.76 
 
 		 461 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  27.76 
 
 		 510 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  25.57 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  25.57 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  25.57 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  25.57 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  25.57 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  25.57 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  25.57 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  25.34 
 
 		 445 aa  86.3  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  26.85 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  25 
 
 		 753 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>