More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2580 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 428 aa  770    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  66.25 
 
 		 461 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  59.41 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  59.41 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  59.1 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  53.49 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  53.49 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  53.49 
 
 		 431 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  54.31 
 
 		 420 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  58.66 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  58.66 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  58.66 
 
 		 445 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  59.69 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  53.95 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  53.95 
 
 		 431 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  53.72 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  58.42 
 
 		 424 aa  288  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  56.06 
 
 		 431 aa  272  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  59.42 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  44.16 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  33.89 
 
 		 431 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  33.17 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  33.42 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  28.43 
 
 		 431 aa  222  9e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  28.43 
 
 		 431 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  28.43 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  30.19 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  29.95 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  29.95 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  30.19 
 
 		 428 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  29.71 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  42.97 
 
 		 417 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  28.72 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  31.78 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  30.85 
 
 		 420 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  30.87 
 
 		 427 aa  152  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  31.87 
 
 		 422 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  32.75 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  31.87 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  31.87 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  31.68 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  33.24 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  30.83 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  30.83 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  30.83 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  30.83 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  30.43 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  32.69 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  30.56 
 
 		 426 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  33.64 
 
 		 417 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  30.94 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  34.49 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  34.05 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  33.24 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  33.24 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  33.24 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  33.24 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  33.24 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  32.8 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  32.98 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  33.24 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  32.8 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  30.08 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  33.42 
 
 		 417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  33.68 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  33.68 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  33.68 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  33.16 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  34.72 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.73 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  29.74 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  38.03 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  31.35 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  30.81 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  30.81 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  30.81 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  30.81 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  32.78 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  34.12 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  25.62 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  27.05 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  28.35 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 544 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  29.25 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.92 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 740 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  30.14 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.02 
 
 		 471 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.02 
 
 		 471 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  25.99 
 
 		 475 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.74 
 
 		 542 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  27.49 
 
 		 555 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  28.2 
 
 		 532 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  27.91 
 
 		 532 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  26.69 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  27.91 
 
 		 532 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  28.22 
 
 		 517 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>