More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1016 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  100 
 
 		 417 aa  815    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  96.4 
 
 		 417 aa  763    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  75.3 
 
 		 416 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  75.3 
 
 		 416 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  75.3 
 
 		 416 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  76.89 
 
 		 417 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  77.28 
 
 		 417 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  73.85 
 
 		 422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  67.32 
 
 		 418 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  65.61 
 
 		 445 aa  518  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  67.8 
 
 		 483 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  67.32 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  67.07 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  67.07 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  67.07 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  67.07 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  67.32 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  67.32 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 420 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  44.06 
 
 		 420 aa  322  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  45.14 
 
 		 440 aa  318  9e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  42.93 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  54.1 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  31.73 
 
 		 425 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  32.26 
 
 		 427 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  33.92 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  32.51 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  34.26 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  32.35 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  32.35 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  32.35 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  32.35 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  32.11 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  31.37 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  31.13 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  31.37 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  34.81 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  31.11 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  28.27 
 
 		 431 aa  145  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.21 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.21 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.1 
 
 		 426 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  29.18 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  22.88 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  25.55 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  25.55 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  25.3 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  25.3 
 
 		 428 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  30.82 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  26.2 
 
 		 428 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  27.29 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 		 461 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  30.42 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  29.35 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  33.16 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  32.08 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  32.8 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  25.32 
 
 		 475 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  27 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  47.67 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  47.67 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  21.17 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.18 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  45.35 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1807  amino acid permease-associated region  21.66 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1109  amino acid permease-associated region  21.66 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.632191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  30.8 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  25.82 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  25.42 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  23.34 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  23.91 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  24.43 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0059  amino acid permease-associated region  28.26 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.32682  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  25.76 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>