More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4598 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  100 
 
 		 420 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  99.05 
 
 		 420 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  99.05 
 
 		 420 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  99.05 
 
 		 420 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  99.05 
 
 		 420 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  71.22 
 
 		 418 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  70.73 
 
 		 445 aa  576  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  71.71 
 
 		 483 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  71.71 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  71.71 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  71.71 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  71.71 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  71.71 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  71.71 
 
 		 418 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  71.71 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  60 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  60 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  60 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  60.29 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  60.44 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  59.51 
 
 		 422 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  60 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  42.82 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  43.49 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  43.07 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  48.78 
 
 		 417 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  36.07 
 
 		 427 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  36.83 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  36.61 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  34.76 
 
 		 418 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  34.06 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  35.55 
 
 		 421 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  33.83 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  33.83 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  33.83 
 
 		 422 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  33.58 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  33.58 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  33.58 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  33.58 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  29.03 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  34.42 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  28.54 
 
 		 431 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  27 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  27 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.89 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 		 425 aa  126  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  29.25 
 
 		 416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  23.87 
 
 		 428 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  23.87 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  23.37 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  24.42 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  29.47 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  28.41 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  25.5 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  29.53 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  30.89 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  23.72 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  44.33 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  44.33 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  44.33 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  44.33 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  44.33 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  44.33 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  46.74 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  29.07 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  23.5 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  24.93 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  25.98 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  24.11 
 
 		 745 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  46.51 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  43.62 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  22.6 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  25.39 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  29.6 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  25.39 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  25.2 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  25.39 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  25.2 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  25.39 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  25.13 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  24.53 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  26.32 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  46.51 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  25.13 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  25.13 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  25.84 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  26.03 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193165  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  26.03 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  26.03 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  26.03 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>