More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2904 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  100 
 
 
422 aa  830    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  37.23 
 
 
428 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  37.23 
 
 
428 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  36.98 
 
 
428 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  37.23 
 
 
428 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  36.98 
 
 
428 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  33.25 
 
 
431 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  33.5 
 
 
425 aa  206  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  32.2 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  31.74 
 
 
431 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  31.74 
 
 
431 aa  196  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  31.74 
 
 
426 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  28.68 
 
 
428 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  31.33 
 
 
420 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  31.33 
 
 
431 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  31.33 
 
 
431 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  31.33 
 
 
431 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  31.33 
 
 
431 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  31.07 
 
 
431 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  31.07 
 
 
431 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 
442 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  33.02 
 
 
423 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  32.82 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  29.98 
 
 
461 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  29.18 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 
425 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  35.42 
 
 
445 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  35.42 
 
 
445 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  35.42 
 
 
445 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  32.22 
 
 
424 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  31.47 
 
 
429 aa  140  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  34.71 
 
 
424 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  26.67 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  26.67 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  26.67 
 
 
416 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  26.99 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  26.99 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  26.99 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  26.99 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  26.2 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  26.72 
 
 
420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 
418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  28.49 
 
 
428 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  26.84 
 
 
426 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  26.93 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  25.94 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  27.81 
 
 
421 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  23.99 
 
 
420 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  26.6 
 
 
422 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  27.03 
 
 
422 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  26.33 
 
 
422 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  26.11 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  27.13 
 
 
418 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  27.13 
 
 
418 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  27.13 
 
 
418 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  26.86 
 
 
483 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  24.3 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  26.54 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  22.88 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  26.72 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  23.91 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  23.04 
 
 
420 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  23.48 
 
 
417 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  25.19 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 
434 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 
435 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.68 
 
 
716 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 
439 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  21.95 
 
 
440 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  29.06 
 
 
440 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3911  amino acid permease-associated region  26.27 
 
 
452 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  24.72 
 
 
475 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  27.53 
 
 
451 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  28.96 
 
 
753 aa  93.6  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.13 
 
 
451 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 
455 aa  92.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  25.74 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  23.64 
 
 
420 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  23.38 
 
 
420 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  23.38 
 
 
420 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  23.38 
 
 
420 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  23.38 
 
 
420 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 
740 aa  87.8  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 
435 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.9 
 
 
542 aa  87.4  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  26.2 
 
 
417 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  26.4 
 
 
466 aa  87  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.92 
 
 
422 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  26.13 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  28.02 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  24.53 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  25.41 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2730  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 
725 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207919  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.11 
 
 
462 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  22.57 
 
 
462 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>