More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3197 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 435 aa  855    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  29.36 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  24.77 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  27.61 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 416 aa  113  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  25 
 
 		 475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  27.76 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  23.45 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  23.45 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  23.31 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  22.97 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  24.26 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  22.85 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  23.51 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  23.18 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  22.91 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  22.49 
 
 		 427 aa  90.1  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  22.16 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1109  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 418 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.632191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1807  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  21.33 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0094  amino acid permease-associated region  24.82 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.699923  hitchhiker  0.000401334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  21.49 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  21.28 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  21.02 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  23.57 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  23.47 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  23.47 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  22.79 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  23.15 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  23.15 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  22.62 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 773 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  24.71 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  23.06 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  23.06 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1612  amino acid permease-associated region  26.51 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000949107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  23.06 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  22.58 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  22.58 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  22.58 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  22.58 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  22.87 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.65 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  23.32 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.65 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  21.99 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  22.6 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  24.31 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  21.56 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  21.56 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.38 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.38 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.38 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  24.08 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.22 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  25.7 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  24.9 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.1 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  24.17 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  22.16 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  25.22 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  22.28 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.1 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2763  ethanolamine transproter  26.32 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0105915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.1 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  23.64 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  23.64 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  23.64 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0232  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  24.31 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  24.31 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  24.31 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  24.11 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  23.64 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  23.64 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  23.64 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  24.31 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  23.64 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>