More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2599 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  100 
 
 		 475 aa  922    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  43.06 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  28.92 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.47 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.47 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.71 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  27.03 
 
 		 418 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  25.51 
 
 		 425 aa  100  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  25.52 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  25.52 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  25.52 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  26.85 
 
 		 437 aa  97.8  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  28.21 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  28.21 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  28.21 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  28.21 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  28.21 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  24.32 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  27.95 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  28.53 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  25.93 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  25.93 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  25.93 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  25.93 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0508  putrescine transporter  26.89 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0717  putrescine transporter  25.62 
 
 		 439 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193165  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  25.93 
 
 		 439 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  26.5 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  25.68 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  25.7 
 
 		 439 aa  86.7  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  26.24 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0180  putrescine transporter  26.33 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  25.65 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  25.97 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3668  putrescine transporter  27.1 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3872  putrescine transporter  27.1 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  27.36 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  25.44 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  26.22 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  26.39 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0277  putrescine transporter  26.79 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4054  putrescine transporter  26.19 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3513  putrescine transporter  26.77 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4085  putrescine transporter  26.19 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  25.32 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3680  putrescine transporter  26.19 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3976  putrescine transporter  26.19 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  25.75 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4172  putrescine transporter  26.19 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  24.54 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  24.66 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4355  putrescine transporter  26.46 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879219  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  24.11 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4011  putrescine transporter  26.46 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  25.47 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  24.6 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  24.13 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  24.13 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  24.47 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  24.4 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  24.13 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  24.13 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  25.08 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  25.08 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  24.4 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  24.47 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  26.32 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  24.13 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  24.17 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  24.73 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  23.85 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  25.07 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04430  L-methionine porter, putative  25.07 
 
 		 580 aa  73.6  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.612306  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  24.33 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1109  amino acid permease-associated region  25.8 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.632191  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1849  amino acid transporter  23.28 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  24.68 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  24.68 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  24.68 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  24.68 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  24.68 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  23.57 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  24.68 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  24.68 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  24.68 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  28.2 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  25.59 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  24.68 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  25.77 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1182  lysine-specific permease  27.47 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000326455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10825  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04990)  26.49 
 
 		 609 aa  70.1  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 745 aa  70.1  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  25.63 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  25.63 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1369  putative lysine-specific permease  27.47 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000742881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  25.63 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>