More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0565 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  100 
 
 		 416 aa  813    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  100 
 
 		 416 aa  813    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  79.33 
 
 		 417 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  100 
 
 		 416 aa  813    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  76.03 
 
 		 417 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  75.3 
 
 		 417 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  70 
 
 		 445 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  71.22 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  70.07 
 
 		 418 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  73.59 
 
 		 417 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  70.07 
 
 		 418 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  70.32 
 
 		 418 aa  543  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  70.07 
 
 		 418 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  70.32 
 
 		 418 aa  543  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  70.07 
 
 		 483 aa  543  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  70.32 
 
 		 418 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  70.07 
 
 		 418 aa  541  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  70.32 
 
 		 418 aa  543  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  60.24 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  60.24 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  60.24 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  60.24 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  60 
 
 		 420 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  46.43 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  47.77 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  46.78 
 
 		 440 aa  332  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  55.23 
 
 		 417 aa  299  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  33.66 
 
 		 427 aa  216  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  34.54 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  36.34 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  33.83 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  36.74 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  31.41 
 
 		 425 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  32.57 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  32.06 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  32.32 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  32.32 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  32.32 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  32.32 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  31.55 
 
 		 422 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  31.55 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  31.39 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 		 431 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  27.38 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  27.15 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  27.38 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  26.67 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  29.69 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  25.52 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  25.52 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  25.52 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  25.52 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  25.26 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  29.43 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  32.28 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  26.93 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  32.06 
 
 		 424 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  27.36 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  33.21 
 
 		 445 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  33.21 
 
 		 445 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  33.21 
 
 		 445 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  34.05 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  26.74 
 
 		 475 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  33.96 
 
 		 424 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  31 
 
 		 461 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  26.34 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  51.16 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  51.16 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  51.16 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  51.16 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  35.37 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  51.16 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  51.16 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  28.23 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  27.13 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  24.46 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  50 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4923  amino acid permease-associated region  26.82 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.441557  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  26.56 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  26.56 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4824  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 641 aa  70.1  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.477626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  26.56 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  26.56 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  22.73 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  30.63 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  29.41 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  23.16 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  26.79 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1611  amino acid permease-associated region  26.89 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  24.91 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  22.97 
 
 		 439 aa  67  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  25.78 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  25.78 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>