More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3765 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 429 aa  802    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  70.69 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  70.69 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  70.69 
 
 		 431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  72.37 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  72.82 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  72.82 
 
 		 431 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  72.82 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  75 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  75.25 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  70.92 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  75.25 
 
 		 445 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  75.51 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  75.25 
 
 		 445 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  75.25 
 
 		 445 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  75.76 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  66.9 
 
 		 461 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  58.78 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  61.8 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  44.82 
 
 		 428 aa  269  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  31.47 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  31.63 
 
 		 428 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  32.12 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  31.63 
 
 		 428 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  31.87 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  31.63 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  29.06 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  29.13 
 
 		 431 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  29.13 
 
 		 431 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  32.45 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  40.68 
 
 		 417 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  33.51 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  33.51 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  33.51 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  33.51 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  32.88 
 
 		 422 aa  159  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  30.97 
 
 		 420 aa  159  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  32.05 
 
 		 422 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  32.05 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  32.05 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  32.82 
 
 		 426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  32.72 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  31.28 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  26.9 
 
 		 425 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  31.53 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  31.53 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  31.53 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  32.71 
 
 		 427 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  31.69 
 
 		 418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  32.8 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  30.59 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  31.7 
 
 		 430 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  31.93 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  30.96 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  32.36 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  28.04 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  31.46 
 
 		 418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  32.8 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  32.8 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  32.8 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  31.22 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  32.53 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  31.22 
 
 		 418 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  31.22 
 
 		 483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  28.81 
 
 		 420 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  32.98 
 
 		 445 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  33.07 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  31.68 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  25.53 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  32.26 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  32.26 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  32.26 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  32.26 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  32.08 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  35.22 
 
 		 417 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  28.39 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.13 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  25.41 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.25 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.25 
 
 		 467 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  27.25 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.25 
 
 		 467 aa  99.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.25 
 
 		 467 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.25 
 
 		 467 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  30.92 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.13 
 
 		 467 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.43 
 
 		 467 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.13 
 
 		 467 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  31.38 
 
 		 716 aa  97.1  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  25.96 
 
 		 467 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  25.53 
 
 		 467 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  27.58 
 
 		 429 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  25.35 
 
 		 475 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  29.05 
 
 		 485 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  31.7 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  30 
 
 		 436 aa  89.7  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.98 
 
 		 476 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  27.69 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>