More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2158 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 461 aa  862    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0990  amino acid permease  62.62 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1337  amino acid permease  62.71 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0259  amino acid permease  62.71 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0381  amino acid permease  62.71 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.364928  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0307  amino acid permease  62.95 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.4886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1833  amino acid transporters  62.95 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1748  amino acid permease  62.95 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.228766  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  64.76 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  64.76 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3765  amino acid permease-associated region  66.9 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1129  amino acid permease  63.72 
 
 		 431 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00552424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  64.02 
 
 		 445 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  64.02 
 
 		 445 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  64.02 
 
 		 445 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  63.68 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4417  amino acid permease-associated region  65.26 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0306277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  56.62 
 
 		 442 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  67.18 
 
 		 428 aa  325  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4326  amino acid permease-associated region  42.16 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  31.98 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  31.74 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  31.85 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  31.5 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  31.5 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  33.18 
 
 		 431 aa  226  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  29.71 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  29.71 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  29.71 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  30.22 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  44.13 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  31.71 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  33.7 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  31.16 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  29.33 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  31.24 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  31.24 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  31.24 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  32.07 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  29.95 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  30.5 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  30.24 
 
 		 440 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  30.75 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  31.28 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  31.52 
 
 		 420 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  31.52 
 
 		 420 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  31.52 
 
 		 420 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  31.52 
 
 		 420 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  31.55 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  30.19 
 
 		 422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  30.19 
 
 		 420 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  29.6 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  29.6 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  30.5 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  30.37 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  29.6 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  29.33 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  29.33 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  31.52 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  29.33 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  31.52 
 
 		 422 aa  126  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  31.25 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  31.25 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  31.2 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  32.34 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  29.81 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  25.53 
 
 		 440 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  26.44 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  26.16 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  32.94 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  26.18 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1386  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  26.44 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  26.44 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.44 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  26.44 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  26.44 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  26.18 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.44 
 
 		 467 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  35.41 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  26.63 
 
 		 475 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  31.58 
 
 		 413 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.09 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.34 
 
 		 542 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  26.4 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.42 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  32.07 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  29.83 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 476 aa  99.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  26.85 
 
 		 468 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>