199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3457 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3457  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 413 aa  782    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.553768  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1807  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1109  amino acid permease-associated region  34.51 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.632191  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0094  amino acid permease-associated region  34.51 
 
 		 417 aa  206  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.699923  hitchhiker  0.000401334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  26.29 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0619  amino acid permease-associated region  30.03 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00318387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  23.52 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  23.52 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  23.28 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3458  inner membrane protein YjeH  27.12 
 
 		 418 aa  89.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0559  amino acid permease-associated region  25.52 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.568403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1325  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.55432 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0565  inner membrane protein YjeH  26.34 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0291  inner membrane protein YjeH  26.34 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0646  inner membrane protein YjeH  26.34 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4288  inner membrane protein YjeH  27.15 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2915  amino acid permease  25.21 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0187  inner membrane protein YjeH  27.53 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4065  amino acid permease-associated region  32.89 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4281  inner membrane protein YjeH  27.53 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0185  inner membrane protein YjeH  27.53 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4149  inner membrane protein YjeH  27.53 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3590  amino acid permease-associated region  32.01 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127433  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2988  amino acid permease family protein  24.93 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.013802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1016  inner membrane protein YjeH  27.58 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0134527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3213  amino acid permease family protein  24.93 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0779  inner membrane protein YjeH  27.45 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00013478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3222  amino acid permease family protein  24.93 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3187  inner membrane protein YjeH  25.07 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3500  inner membrane protein YjeH  25.06 
 
 		 422 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000277884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4670  inner membrane protein YjeH  23.63 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2904  transporter, putative  23.08 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00107309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0317  inner membrane protein YjeH  24.55 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0328  inner membrane protein YjeH  24.23 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.948313  hitchhiker  0.0000455474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2580  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2641  amino acid permease family protein  24.64 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3265  inner membrane protein YjeH  24.46 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000385883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4565  inner membrane protein YjeH  24 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1853  putative amino acid transporter  32.35 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3833  inner membrane protein YjeH  26.46 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3760  inner membrane protein YjeH  26.19 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0244  inner membrane protein YjeH  24.31 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3339  amino acid permease-associated region  32.55 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4189  amino acid permease-associated region  32.55 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.751541  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4178  amino acid permease-associated region  32.55 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3958  inner membrane protein YjeH  26.19 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3871  inner membrane protein YjeH  23.63 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.915973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04011  predicted transporter  23.63 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03973  hypothetical protein  23.63 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3851  amino acid permease-associated region  23.63 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4696  inner membrane protein YjeH  23.63 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4382  inner membrane protein YjeH  23.63 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.417651  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2158  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4610  inner membrane protein YjeH  23.63 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401918 
 
 
-
 
NC_002978  WD0957  amino acid permease family protein  26.62 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.253131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2599  putrescine-ornithine antiporter  25.36 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0674165  normal  0.681763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5657  inner membrane protein YjeH  23.63 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0960639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6652  amino acid permease-associated region  31.67 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3546  inner membrane protein YjeH  29.87 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.156536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05335  inner membrane protein YjeH  24.24 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3597  inner membrane protein YjeH  22.88 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000553  amino acid transporter  23.59 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0285  inner membrane protein YjeH  24.34 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  26.28 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  31.2 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1689  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0390  inner membrane protein YjeH  24.49 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4606  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4725  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.201688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4746  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.733754  normal  0.566679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4689  inner membrane protein YjeH  22.7 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  32.17 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  29.97 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.24 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4598  inner membrane protein YjeH  22.16 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  28.81 
 
 		 571 aa  56.2  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  27.46 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  30.05 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 571 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  26.09 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  30.48 
 
 		 485 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5286  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 483 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5375  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 483 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  24.24 
 
 		 500 aa  53.5  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  30.06 
 
 		 510 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  27.76 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  30.06 
 
 		 513 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000000642825  decreased coverage  0.00000288489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.25 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  25.47 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  28.61 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0043  amino acid permease-associated region  30.54 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979083  normal  0.243492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5665  amino acid permease-associated region  29.34 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000491134  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  24.04 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  25.38 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3197  amino acid permease-associated region  20.75 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048161 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>